對於一些大公司的網站和內部網絡，美國國家安全局則通過後門和植入病毒的方式實施竊密。據《美國全球監聽行動紀錄》，“棱鏡”項目相繼與微軟、雅虎、谷歌、臉譜、PalTalk、YouTube、Skype、AOL和蘋果等9家互聯網公司合作，數據會通過這些公司的服務器傳輸給美國政府，有時一些公司的服務器還會建立獨立安全入口，以便政府由此調取信息。情報人員可直接進入上述公司的服務器和數據庫獲取數據，甚至可直接監控用戶網絡搜索內容。
另外，據一名不願透露姓名的中國軍事專家介紹，美國公司對外出售的一些服務器、程控交換機具備遠程維護功能。也就是通過網絡，由其母公司對服務器、交換機進行診斷和維護，而如果在這項功能中提前設置“後門”，那意味著美國即便不與網絡經營商簽訂協議，也可以任意複制服務器上的信息，或者通過這種方式監控重要用戶信息。
美國還廣泛通過植入病毒等黑客手段竊取信息。美國國家安全局在1997年就下設“獲取特定情報行動辦公室”，主要任務是通過秘密入侵目標計算機和電信系統、破譯密碼、攻破受保護目標計算機的安全系統等，竊取存儲在目標計算機中的數據。很多大型公司的網絡就是這樣被攻克的。
另外，對於一些與外部網絡進行物理隔絕的內部網絡，美國也有技術手段進行攻克。例如，通過“廣泛撒網”的方式，將一些病毒植入目標用戶的個人計算機。當該用戶通過移動存儲設備或光盤，在染毒的計算機和內部網絡之間進行數據交換的時候，病毒就可能被複制到其內部的計算機網絡中，並收集相關情報，然後再通過移動存儲設備複制到連接互聯網的電腦上，傳回情報機構。美國情報機構還在研發電力線竊密手段，也就是通過計算機的電源線竊取相關信息。當然，這需要對目標計算機使用事先被植入後門的芯片。
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