在浙江工作期間，習近平同志多次指示省社科聯組織力量深入研究浙江歷史文化、解讀浙江現象、總結浙江經驗、豐富與發展浙江精神，推動浙江又好又快發展。為此，省社科聯立即著手論證和編制“浙江文化研究工程”的有關方案。省委和省委宣傳部領導多次聽取方案匯報，指導方案的論證和完善。經過近一年的準備和籌劃，文化研究工程構想逐漸成熟。
2003年7月，省委十一屆四次全體(擴大)會議提出了“進一步發揮浙江的人文優勢，加快建設文化大省”的戰略任務，將之作為“八八戰略”的重要內容。2005年7月省委十一屆八次全會通過《關於加快建設文化大省的決定》。這個綱領性文件把“文化研究工程”納入加快建設文化大省的“八項工程”而正式提上了建設日程。2005年8月，省委下發“關於印發《浙江省文明素質工程》等八項工程實施方案的通知”，對實施包括“文化研究工程”在內的“八項工程”作了具體部署。
習近平同志擔任第一任指導委員會主任。他一直高度關心、重視並親自指導、謀劃和布局文化研究工程的實施。2005年8月30日習近平同志主持召開指導委員會第一次會議，標誌著文化研究工程正式啟動。2006年習近平同志親自為浙江文化研究工程成果文庫作總序，在工程實施過程中多次作指示、出題目。在擔任總書記後，他欣然同意二期工程繼續保留十年前他作的“總序”。歷屆省委、省政府按照習近平同志的頂層設計，堅持將文化研究工程一張藍圖繪到底，一任接著一任幹，持之不懈抓落實，在繼承與創新上下功夫，在加強建設上謀新招，既一脈相承、一以貫之，又與時俱進。趙洪祝同志、夏寶龍同志相繼擔任指導委員會主任，多次就加快推進文化研究工程作出指示，要求繼續完善規劃、強化管理、注重品牌，不斷提升文化研究工程成果質量。
根據習近平同志的要求，浙江文化研究工程重點研究“今、古、人、文”等四個方面，即“浙江當代發展研究”“浙江歷史文化專題研究”“浙江名人研究”和“浙江歷史文獻整理”等四大板塊，開展系統研究。圍繞這一中心任務，省委宣傳部、省社科發展規劃領導小組加強領導，提供條件，督促落實工程建設。省社科聯作為具體組織實施單位，積極建立和完善機制，在工程實施之初就成立了文化研究工程辦公室，聚焦主攻方向，積極組織制定研究規劃、搭建研討平台、整合研究力量、培育學術團隊，跨地區跨學科地確立了“科學發展觀與浙江發展研究基地”等20多個省哲學社會科學重點研究基地，凝煉了數十個與浙江當代發展和浙江歷史文化密切相關的研究方向，嚴格監督和把控成果質量。全省廣大哲學社會科學工作者為工程的順利實施傾注了滿腔熱情，提供了強大智力支持，先後有1000餘位專家學者參與工程項目研究。他們兢兢業業、刻苦鑽研，將畢生所學貫注於一功，絕大部分項目耗時一年以上，有些研究項目耗時數年，數十人參與。
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