分析藍綠兩大陣營的得票情況，蔡英文拿下689萬多張選票票，只比她在2012年選舉中的總得票數多出80萬票，並未打破馬英九在2008年及2012年兩次選舉中的得票數。這說明蔡英文和民進黨背後所代表的綠營基本盤在過去四年裡並沒有很大的增長。從國民黨選票的流失來看，藍軍士氣渙散、不願意出門投票才是國民黨敗選的主因所在。因此，蔡英文增長的80萬張選票，其實多數是來自年輕人或不滿馬英九執政表現的一些選票，而國民黨的傳統選票更是被藍軍所抵制，從這個層面分析，此次選舉並沒有使藍綠結構大崩解，台灣政治生態中的藍綠結構仍然存在，只是繼續朝藍消綠長的態勢在發展。此外，在這次選舉中，親民党的宋楚瑜拿到158萬票，較四年前多了120萬票，顯示藍軍過去在選舉中的“棄保效應”並未發酵，這在一程度上或許也可以說明，台灣社會確實出現了某種希望裂解藍綠的政治力量，而且這股力量正在隱隱騷動，其未來發展前景還需要觀察。
最後，台灣地區2016年選舉中以時代力量為代表的第三勢力興起，無疑會對未來台灣政治生態及政局走向產生影響。
在2016年台灣大選中，第三勢力成為一股不容小覷的政治力量。依據台灣地區“公職人員選舉罷免法”之規定，在本次選舉中政黨得票率達到3.5%的政黨，都可以獲得每年每票50萬新台幣的補助，而在此次選舉中，除了民進黨和國民黨兩大政黨外 還有包括時代力量、新黨、親民黨等三個小黨均跨越3.5%補助款門檻。④也就是說，在未來四年，這三個小黨每年都將會得到一筆數額不菲的選舉補助款，不但有助於保障這些小黨維持黨務運作的基本開銷，而且也有助於台灣政治中的第三勢力為爭奪下次選舉進行全面佈局。
第三勢力在這次選舉中的竄起，特別是時代力量等小黨的政黨票能夠跨越5%門檻，其對台灣政治生態的影響相當大。以時代力量為例，不但提名的黃國昌、林昶佐及洪慈庸在所在選區都順利當選，而且時代力量在其他選區的很多提名人選雖然最終沒有當選，但其得票數幾乎都衝破了一萬，代表第三勢力很有可能在未來能夠殺出藍綠之外的第三條路。以台北市為例，第三勢力在台北市各選區幾乎都拿下超過一萬票門檻的成績，這說明選民對原本的立法機構和政治生態不夠滿意，選民期待能夠有不同的多元的聲音。此外，也說明台灣選民對傳統藍綠兩大政黨盤根錯節的政商關係有一定的反感。⑤
隨著第三勢力對政治的影響加強，未來無疑會對民進黨執政有所牽制，台灣立法機構中的政治紛爭無疑會進一步加劇。
當然，台灣政治生態中的第三勢力未來是否能夠真正崛起，恐怕還不宜過早下結論，特別是還需要在下一次的選舉中的表現加以驗證，以時代力量為例，它在意識形態領域還是屬於綠營，從選舉結果來觀察，它在此次選舉中只是取代了台聯，特別是在民進黨的強勢執政下，時代力量未來如何與民進黨互動還需要持續觀察。
（二）兩岸關係互動出現的新形勢
首先，民進黨過去長期堅持的分離主義政治意識形態是影響兩岸關係和平發展的重要隱患。
民進黨至今並未放棄分離主義的政治意識形態，這是影響未來兩岸關係發展的最大隱患和挑戰。隨著民進黨在2016年台灣地區大選中獲勝，重返執政的民進黨未來如何處理兩岸關係議題無疑是各方關注的焦點。但從過去的經驗來看，民進黨未來處理兩岸關係的前景並不樂觀。目前民進黨的黨綱還是“台獨黨綱”，這表明民進黨並未放棄“台獨”分離主義的政治意識形態之堅持，這無疑與中國大陸長期堅持的追求國家最終統一的政治堅持相對立，由於領土完整與主權統一關乎到國家核心利益與中華民族最高利益，因此，分裂與統一是一對完全不可能有任何調和空間的矛盾關係。隨著民進黨在這次選舉中大勝，綠營“獨”派政治勢力追求“台獨”的企圖心必然會隨之增長，不排除未來有膨脹的可能性，這些都會對兩岸關係帶來非常嚴重的衝擊與挑戰。事實上，發生這種情形的可能性是客觀存在的，無法排除。以兩岸政策主張為例，儘管蔡英文強調未來其兩岸政策要超越政黨的主張，⑥但由於民進黨本身意識形態的堅持，特別是綠營內部“獨”派勢力的反彈，都有可能會極大地限制民進黨執政後的兩岸政策調整，不排除民進黨未來兩岸政策走向更為保守的方向上去。
其次，民進黨執政後在諸如南海、東海等事關整個中國主權議題的表態及具體政策都會對兩岸關係發展帶來很大的變數。
以南海為例，儘管民進黨領袖蔡英文尚未就南海主權提出清晰的主張，但她和民進黨對維護南海主權的消極態度還是非常明顯。特別是近年來民進黨內部尤其是部分綠營政治精英出現了要公開放棄南海主權的論調。⑦事實上，民進黨在過去幾年對南海問題的主張多強調透過多邊對話機制，這不但與大陸長期堅持的主張雙邊對話機制相對立，而且民進黨一直回避對南海主權“斷續線”的表態。目前大陸和國民黨對南海的主權堅持存在很大的共通性，就是雙方對南海主權最主要的依據是歷史，因為中國政府最先發現、經營和管理了南海，這一點民進黨從未提及過。其原因主要是民進黨基於分離主義的意識形態，不願意承認台灣與大陸的某種連接。蔡英文提出的“南海航行自由”等南海政策主張在總體上具有非常強的對抗大陸、配合美國南海政策主張的特性。⑧在當前中國大陸崛起的背景下，特別是中國大陸在與美日就中國海洋主權爭議日益加劇的情勢下，民進黨的南海及東海等主張如果背離了中華民族的整體利益，當然會加劇大陸對蔡英文和民進黨的不信任程度，也會對兩岸關係發展帶來重大的衝擊和挑戰。
再次，民進黨對九二共識這一兩岸政治基礎的基本態度與立場是影響兩岸關係和平發展的重要變數。
“九二共識”的核心價值並不在這具體的四個字上，而是其背後的政治意涵，即兩岸均堅持一個中國的政治共識。1992年海峽兩岸兩會“海協會”與“海基會”在新加坡進行會談，最終達成了各自以口頭方式表述“一個中國”的意涵。這是海峽兩岸在兩岸同屬“一個中國”問題上達成了共識，也就是說海峽兩岸當時就“一個中國”的內涵是達成了共識的，並非如民進黨領導人蔡英文所講的雙方只是求同存異。⑨蔡英文未來如果能夠就九二共識的核心內涵進行正面表態與公開接受，大陸方面當然會願意與其交往。習近平總書記曾在兩岸領導人會面上的場合公開表示，台灣無論哪個黨派、團體，無論其過去主張過什麼，只要承認“九二共識”的歷史事實，認同其核心意涵，大陸都願意同其交往。⑩但如果蔡英文仍然在“九二共識”問題上還是繞圈子，始終不肯回到兩岸同屬一中的框架上來，大陸當然不會與民進黨執政當局進行任何交往與接觸。兩岸關係和平發展進程必然遭到重大的挑戰。蔡英文一直宣稱想建構一個有堅實民意基礎，以“維持現狀”的台灣共識為核心，遵循“中華民國”憲政體制，並在二十多年兩岸協商和交流互動的基礎上，推動兩岸關係和平穩定發展的新互動架構。⑪但必須看到，蔡英文對“九二共識”的表態仍然模糊，特別是她對兩岸關係的核心和本質這個問題還是持回避的立場，即兩岸關係到底是什麼樣的關係，是一國關係還是兩國關係？蔡英文仍然在打迷糊仗，還是不願意說清楚講明白。蔡英文所謂的“既有政治基礎”只有與“九二共識”相銜接，只有體現出“兩岸同屬一中”的內涵，才能維繫好兩岸關係的和平與穩定。⑫因此，蔡英文當前對兩岸關係和平發展政治基礎的表態至關重要。
最後，民進黨執政後所推行的對外政策特別是其親美日遠大陸之戰略也將會影響兩岸互動的總體氛圍，給兩岸關係發展造成重大的傷害。
長期以來，民進黨的對外政策思維往往受制於其“台獨”意識形態之束縛。民進黨政治精英在潛意識裡常常將拉攏美日等境外強權勢力作為抗拒兩岸未來走向統一的重要籌碼。親近美日、疏遠大陸是綠營政治人物心目中普遍存在的邏輯。重返執政的蔡英文基本上也在重復民進黨的傳統邏輯。例如，蔡英文在選前大陣仗率團赴美日等國接受“面試”，不但與這些國家的政要進行密切交流與互動，而且選擇在美國將其“維持兩岸現狀”主張進行闡述，選後也派出重量級親信赴美進行溝通。同時，蔡英文針對兩岸經貿關係日前密切的現狀，也提出了未來要開展“新南向”及加入美國主導的TPP（Trans Pacific Partnership Agreement，簡稱“TPP”）等政策主張。特別是民進黨希望透過參與TPP，建立與美國經濟上的戰略夥伴關係，並減少台灣對於中國大陸市場的依賴⑬。特別是當前美國重返亞太的動作正牽動亞太區域新情勢。民進黨未來如果認為台灣在美國眼中的角色愈來重要，甚至不惜成為美國在亞太地區推行“再平衡戰略”的棋子，則可能會產生難以預料的政治後果。畢竟民進黨和北京原本就缺乏互信基礎，台美關係之深化也可能招致北京更多的猜疑及反制，更可能會使蔡英文將面臨更為嚴峻更為複雜的兩岸新情勢。事實上，當民進黨勝選後，綠營內部有不少學者認為，蔡英文執政上台後應該讓兩岸經貿先冷卻下來，並加強與歐美等國家貿易關係。縱觀目前島內政治生態發展，特別是綠營不但掌握行政大權，而且也完全主導立法機構，不排除綠營會對中斷過去八年馬英九執政當局所推行的兩岸政策路線，這些當然都會對兩岸關係發展有負面影響。
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