歸屬 中央地方七三開
對於碳稅的歸屬，國家發改委和財政部的專家稱，碳稅的收入歸屬上有三種選擇，即地方稅、中央稅、中央與地方共享稅。一般而言，根據中央稅與地方稅的劃分標準，地方稅應該是具有非流動性且分布較均勻、不具有再分配和宏觀調控性質、稅負難以轉嫁性質的稅種。而碳稅對整個宏觀經濟、產業的發展產生影響，還涉及一個國際協調的問題。
從這個角度看，碳稅不宜作為地方稅，作為中央稅更為合適。但考慮到我國目前地方稅稅收收入過低，為了調動地方政府的積極性，建議將碳稅作為中央與地方共享稅，中央與地方分成比例為7∶3。
北京環交所董事長熊焰表示，“如何合理的設計碳稅確實是特別複雜。碳稅當然是普遍增收的，但在有懲罰機制的同時，獎勵機制也應有。”
世界資源研究所(WRI)中國首席代表鄒驥在接受記者採訪時表示，理論上說，誰污染就對誰徵稅，專款專用，可以用於搞研發投資，可以補貼新能源企業。上世紀90年代以來，這成為歐洲一些國家的主要做法。
中信產業基金董事長劉樂飛介紹說，歐洲美國新能源低碳項目之所以能這麼成功的運行和發展，主要原因是它的政策是非常明確的，比如說建一個太陽能電站，政府則給企業什麼樣的補貼，以保證企業有較好的回報。建設太陽能電站在德國投資回報率接近10%，東歐的一些國家投資回報能達到15%左右，這樣的投資回報帶動了很多機構建設太陽能電站。“所以只有政府的政策，包括政府的補貼，能夠真正明確了之後，我想才能夠帶動低碳經濟發展。”劉樂飛表示。
國家發改委、財政部的研究報告稱，由中央財政集中碳稅收入用於支持節能、新能源和可再生能源利用、新能源技術開發以及其他節能事業的發展。還需要建立規範的財政轉移支付制度，重點考慮低收入或經濟發展水平低的地區，平衡地區間減排成本和收益的分配格局。
從強化我國財政管理的角度出發，碳稅的收入也有必要納入預算管理，與其他稅收收入統一進行使用和管理。鑒於我國現階段的經濟發展水平尚低，節能減排方面所需的資金不足，因此，財政有必要合理地利用碳稅收入，加大在節能環保方面的支出。
研究報告表示，碳稅收入應該採用以下使用內容和方式：一是用於重點行業的退稅優惠和對低收入群體的補助等方面；二是可以建立國家專項基金，專門用於應對氣候變化、提高能源效率、研究節能新技術、新能源技術開發、新能源和可再生能源利用、實施植樹造林等增匯工程項目以及加強有關的科學研究與管理，促進國際交流與合作等方面；三是在具體使用方式上，應該更多地採用財政貼息等間接優惠方式，而較少採用直接補貼的方式，更好地發揮碳稅的作用。 |
