但這場戰爭並未完全結束，依然存在不少懸念。首要的懸念是，卡扎菲及其支持者將如何做最後的抵抗，其命運將會如何。目前反對派並未控制的黎波里所有城區，卡扎菲仍有一些裝備精良的支持者，在城市戰中，北約的空襲幫助不大，相對缺乏訓練的反對派軍隊仍有可能遭受一定傷亡。據報道，今天的黎波里已經發生了一些巷戰。此外，無法確定卡扎菲是否在的黎波里。如果是在他的老家蘇爾特，那他仍有可能負隅頑抗一段時間——當地部落似仍支持卡扎菲。如果他選擇流亡，也有一定的躲藏空間——2003年伊拉克前總統薩達姆是在被推翻八個多月後才被抓獲的。
第二個懸念是，北約接下來將會如何行動。北約的空中配合是反對派攻入的黎波里的必要條件，但北約與反對派之間一直關係微妙。起義剛開始的時候，反對派曾有發言人表示不願外國介入，準備靠自己的力量擊敗卡扎菲，但在情勢逼迫下，不得不呼籲援助。北約雖然以聯合國禁飛區授權為由進行空襲，其實則差不多是介入了一場別國的內戰。對於北約空襲利比亞的一些設施是否符合聯合國的授權，一些國際法學者已提出質疑。當初聯合國授權乾預的目的是保護利比亞平民免遭卡扎菲政權的屠殺與武力威脅，如果卡扎菲政權崩潰，政府軍瓦解，這種威脅降低，北約應考慮逐步停止對利比亞境內目標的空襲，這也有助於在卡扎菲被推翻後，新政府與西方保持比較良好的關係。
文章表示，第三個也是最大的懸念是，如果卡扎菲政權確實迅速垮台，後卡扎菲時代的利比亞能否順利轉型。卡扎菲數十年的家長式集權統治，使利比亞缺乏一些現代治理機制，如政黨制度、公民社會等。東部反對派成立國家過渡委員會後，至今仍未組成一個完善的政府，且內部派系林立。7月底反對派軍事領袖尤尼斯被殺，此事至今未完全調查清楚，這也提醒人們註意反對派內部分裂的危險。
反對派的另一個挑戰是東西部之間可能的矛盾。在幾個月的戰爭裡，作為主力的東部反對派基本未能取得多少突破，對的黎波里的致命一擊是由西部反對派發動並完成的，但西部反對派在政治上仍在被東部“代表”。歷史上利比亞東西部就是兩個不同地區，東部傳統上稱為昔蘭尼加，西部為的黎波里塔尼亞，二戰後才粘合在一起。卡扎菲倒台後，利比亞能否安定繁榮，取決於東西部反對派能否精誠合作，分享政治權力與經濟利益（尤其是後者中的石油利益）。
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