國民黨若能贏得選舉，兩岸關係和平發展格局將得以維持並得到新的發展，兩岸經濟合作將持續深化，各項交流會持續進行與擴大，但經濟協商與合作也面臨新的挑戰，雖然兩岸投資保護協議有望在選後簽署，並啟動ECFA的後續協商，但難度很大，台灣方面一直期望進行分割式的次早收清單模式，即將台灣關注的對大陸出口貿易產品納入早收清單，而不願簽署具時間表的整體性貨物貿易協議。
大陸企業赴台投資政策有望進一步放寬，但能否實行“負面表列”的公平待遇仍有困難。兩岸金融領域交流與合作會有新的發展，尤其是簽署貨幣清算協議、兩岸貿易用人民幣結算有望實現，兩岸合作共同應對國際金融債務危機有望獲得新的突破，機制化合作兩岸產業合作雖有共識，也會積極推進，但因利益與競爭問題，由兩岸有關部門主導協商的產業合作有很多困難，市場機制仍將是主導力量。儘管困難增多，但兩岸經濟交流合作的深化是不可避免的趨勢，並有重大新發展，兩岸貿易與投資發展規模、金融與產業合作等將邁上一個新的台階。
馬連任後，兩岸軍事互信機制與兩岸政治關係的推進還難很突破，但不排除局部性的或低度政治問題的協商與推進。兩岸需要努力營造兩岸領導人的正式接觸與面會的條件，通過發表會談新聞或共識的方式，開創兩岸關係互動與發展的新局面。
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