新公民學校希望由政府“委托辦學”的請求並未被朝陽區教委考慮。眼見學校難逃被關停命運，基金會方面又提出三點要求：保證不讓一個孩子失學，不設置任何入學門檻；保證每一位教職員工的合法權益，妥善安置他們的工作，或給予合理的經濟補償；對南都公益基金會和其他愛心機構、人士在北馬房和馬各莊學校的全部公益投入進行補償。
然而，就當前政府提供的分流方案來看，被分流的學生要進入公立學校的“五證”（戶籍、暫住證、原籍地沒有監護條件的證明、在京實際居所證明和工作證明）門檻並未降低，委托辦學學校更將門檻提高到“七證”——同時還要求提供借讀證和學生接種本。
基金會方面認為，這“七證”就足以攔住不少跟著父母來到城市的孩子。7月初，南都基金會向朝陽區委、區政府發出公開信，其中提出，如果學校正當、合法的要求不能得到滿足，南都基金會將依據《中華人民共和國公益事業捐贈法》、《基金會管理條例》和《中華人民共和國民辦教育促進法》等法律法規，通過法律途徑來主張自己的合法權益，聯合主要捐贈人共同起訴索賠。 |
