袁亞湘說，任何一個普通公民觸犯法律都要受到制裁，院士如果出現問題，當然也應退出，這個很容易理解。
兩院院士章程規定，當院士的個人行為觸犯國家法律，危害國家利益或喪失科學道德，違背院士標準，有不少於5名院士書面提議，要求撤銷其院士稱號時，由其所在學部常務委員會受理並審議後，通過所在學部全體院士投票表決，可作出撤銷其院士稱號的決定。
華東理工大學原校長陳敏恒曾是中國科學院院士，上世紀90年代，他指導的博士胡黎明出現了論文抄襲醜聞，而他本人也是抄襲論文的署名作者之一。2000年，按照章程，經院士投票，中科院撤消了陳敏恒的院士稱號，並在2000年的院士大會上公布。
但是，對於“院士退休”一說，很多院士表示費解。 中國科學院學部主席團成員、“嫦娥三號”探測器系統首席科學家葉培建院士對中國青年報記者說：“‘院士退休’是個偽命題。”
中國科學院、中國工程院院士，分別是國家設立的科學技術方面、工程科學技術方面的最高學術稱號，屬於終身榮譽。葉培建指出，院士既然是個榮譽稱號，不是一個工作崗位，就沒有“退休”一說。退休，應該是從工作崗位上退休。
“就像一個人是勞動模範、戰鬥英雄，不能說他老了，就把這個稱號撤掉。院士也是一樣的。院士是對一生的科技方面的評價。”周其鳳也指出，如果一位院士不符合標準，可以取消稱號，讓其退出，但退休是另一回事，它是一個行政上的概念。
葉培建指出，從來沒有任何一個文件規定“院士不退休”。但客觀來說，很多單位不願意讓院士離開單位，這樣能夠“替本單位說說話，多申請項目”，因此院士在工作崗位上退休的很少。
這些單位的主要依據，是1983年國務院發布的《國務院關於高級專家離休退休若干問題的暫行規定》。其中提到，“學術上造詣高深、在國內外有重大影響的傑出高級專家，經國務院批准，可以暫緩離休退休，繼續從事研究或著述工作”。
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