海基會內部人員轉述高層的看法說，目前各項協議業務溝通，都由政府各部會直接進行，不會透過海基會，“台方談判底線，海基會根本無從得知。”
至於陸委會方面，一位中階主管私下表示，為何會演出這齣大戲，他們實在搞不懂，也很無奈，近日工作量還因此大增，感覺比以前加班時間更多。
此外，張顯耀案也震驚過去曾任職的海陸高層主管，多數認為兩岸關係必受衝擊。前陸委會副主委趙健民認為，貨貿就是明顯例子，目前已傳出陸方可能再度延遲貨貿的談判。
朝野：衝擊兩岸談判
民進黨執政時期擔任陸委會副主委的邱太三也指出，張案對兩岸關係後續影響“一定會有衝擊”；不過，他懷疑此案是否會影響海陸同仁士氣，畢竟這與其他人無關。
曾任海基會董事長的洪奇昌則表示，張案不管真相如何，都凸顯兩岸談判應更公開透明，以及“兩岸監督條例”存在的必要性，而張案短期絕對會衝擊兩岸談判進程。
針對張顯耀事件會否影響兩岸談判，陸委會表示，參與協商同仁，只要遵守相關法令規定並確實依據協商方案與陸方進行協商，不會有綁手綁腳或發生寒蟬效應問題。 |
