此時，國企普遍處於產能下降，入不敷出期間，很多醫院也是如此，尤以極度依賴國家輸血的一二級醫院及消防、武警醫院為主。游醫們掛靠在醫院下，以其特殊的賄賂技巧，從當地衛生部門買來行醫執照。於是，大大小小的特殊門診以及個人門診便開始出現在各個大小城市的街道、社區。
到90年後期，莆田人已不滿足於私立門診，他們承包下一個個科室，借著公立醫院的“外皮”來達到其牟取暴利的目的。
莆田系診所們此時開始搶先涉足整形行業。2000年以後，整形美容醫院已成為了莆田系的絕對主力。搭配傳統的男科／婦科醫院，加上各類門診部，形成了完整的產業鏈。
隨著政府對醫療電視廣告的打擊，以及公立醫院治療的正規化，絕大多數疾病上莆田醫院都已經無法與正規公立醫院爭鋒了。此時網絡成為了莆田系宣傳主戰場，莆田系大筆投入廣告。
莆田系和百度雖關係密切，也曾鬧得不可開交。2015年3月，百度官方對莆田系醫療商態度強硬，表示不會動搖“高門檻、嚴審核”決心，並加大整治以莆田系為代表的違規醫療推廣”。
2010年後，割包皮，無痛人流開始逐漸成為莆田系新的市場立足點。其甚至開始通過校學生會關係或贊助各種校內活動來明目張膽地在校園內做廣告。
莆田系還在向醫療產業的上游發展，通過生產醫藥、醫療儀器等，並多在莆田系醫院內部銷售，以遠高於市場均價的價格銷售給患者。
附：部分莆田系民營醫院名單
1、詹氏集團
詹國團：上海華衡投資（集團）有限公司
上海衡域實業有限公司
上海新鐘廣告有限公司
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