第六，仲裁改變了南海博弈的遊戲規則，以此導致的有關各方利益訴求調整，致使《南海行為準則》的磋商增添變數，達成協議的增加難度。
第七，南海危機會外溢。民進黨的台獨理念決定其南海政策和大陸漸行漸遠，今後基本走向是切割大陸、迎合美日、呼應東盟，兩岸南海政策和主張分歧成為變數。如果台灣迎合美日的戰略需求，或者成為美日在南海問題上牽制中國戰略的一部份，則南海危機或者危機外溢將同步發生。
第八，南海周邊國家海上執法力量難以避免。周邊國家都試圖以加強執法力量來加強在南海上的存在感、強化實際控制。不過，目前南海安全機制缺失，危機管控機制還在磋商中，各國海警之間沒有共同規則，短時間內也難以達成共識。
第九，海上合作和共同開發難以為繼。儘管中國致力於各國的共同合作和開發，提升聲索國之間的政治信任，但其他國家的主要興趣和利益取向，集中在如何在仲裁後，按照新遊戲規則鞏固既得利益的同時，謀求自己利益的最大化。
吳士存表示，未來的南海尤其中美需要加強合作。在中美博弈成為南海爭議的主線時，他提出以下五點建議。
第一，中美在南海應構建避免誤判、減少對抗、管控危機的軍事關係。美國應對抵近偵察、進入中國控制島礁十二海里保持克制，避免利用裁決向中國施壓，或者把日本及其盟國納入針對中國的南海聯合巡航活動中，不要在南海周邊地區建設針對中國的軍事基地，或進行聯合軍演。作為回應，中國也降低島礁建設的軍事化程度，提高南海島礁的公共服務功能，避免黃岩島進行島礁建設，避免宣佈南海防控識別區。
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