在此階段，台灣島內藍綠政治博弈進入了最激烈的階段，出現了藍長綠消的新形勢，國共兩黨衝破歷史藩籬實現了大和解，以“九二共識”為綱領，以和平發展為過程的國共政治共識得到台灣同胞的肯定與支持。兩岸關係出現了進入和平發展的重大機遇。但是與此同時，也是統獨輿論交鋒、統獨意識對立異常激烈的時期，陳水扁推出了“一邊一國”的論述並終止《國統綱領》，而大陸則出台了《反分裂國家法》。但是，民進黨內對大陸有客觀認識的智者為數不少，他們也提出了許多發展兩岸關係積極意見。中共在積極與國民黨交往的時候，也願意與民進黨內部的務實派與有識之士進行交往與交流。大陸高層明確表示：即使是那些曾經支持過、追隨過、從事過“台獨”的人，只要他們有改善和發展兩岸關係的意願，也歡迎他們加入到兩岸交流合作的行列中來。
對於這一時期的兩岸關係和平發展，美國不僅不反對，也清楚認識到不支持“台獨”才能確保中美關係的平穩與合作，對於陳水扁試圖在中美關係之間進行挑釁、而自己坐山觀虎鬥的圖謀，中美之間有共識，那就是陳水扁是“麻煩製造者”，美國必然會拋棄之，大陸必然會打擊之。最終，民進黨丟失了政權，馬英九與國民黨重新執政。兩岸關係由此進入兩岸關係歷史上至為重要的和平發展新時期，這也是和平發展理論的實踐新階段。
在這短短的4年，也是中國評論發展史上最為關鍵、最為重要、最為成功的時間節點：第一，成功構建了兩岸關係歷史上第一家“網絡媒體”，第二，成功構建了兩岸關係歷史上第一家“兩岸共同媒體”。新構建的兩岸中評社在最短的時間內，既能參加大陸最高領導人的出訪活動，也可以隨台灣領導人出訪，並得到得了與台灣藍綠政黨領袖密切接觸的機會，這是兩岸以及香港、澳門的新聞媒體中，從未企及的政治高度和政治待遇。中國評論通訊社、中評網一誕生，即成為兩岸關係中最為重要、最具效力、最可信任的傳播溝通平台。
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