中評社香港10月29日電／29日，記者從河北農業大學獲悉，河北農業大學教授劉孟軍帶領其棗研究團隊，通過與深圳華大基因科技有限公司等多家單位密切合作，在世界上率先完成了棗樹的全基因組測序。
新華社消息，棗樹原產於中國黃河中下游地區，是中國最古老的樹種之一。據化石和出土文物考證，棗樹在中國存在已超過1000萬年。中國棗樹的栽培面積和產量均佔到世界的99%，且棗樹已被引種到亞洲、非洲、美洲、歐洲和大洋州的40多個國家和地區。
基因組測序是打開生物學奧秘的金鑰匙，同時也是一項非常複雜的系統工程。2010年，河北農業大學劉孟軍教授帶領其棗研究團隊，在20多年棗樹科研積澱基礎上，開始了棗樹全基因組測序。
“在本項目啟動前，有關棗基因組測序的基礎工作還非常薄弱，甚至連棗的基因組是多大都不知道。”劉孟軍告訴記者，“棗的基因組屬於高度複雜的類型，它的雜合度是當時利用第二代測序技術植物中最高的，而且其重復序列比例偏高，GC含量偏低，使得其測序和組裝難度增大。”
劉孟軍說，“我們在第二代測序技術基礎上，採取了PCR－free和BAC－to－BAC等多種技術措施和方法，有效地克服了高度複雜棗基因組的測序、組裝以及填圖補洞等一道道難題，最終我們順利完成了我國著名棗品種‘冬棗’的全基因組從頭測序，並且獲得了高品質的棗基因組序列。
該研究項目共組裝出438M的序列，佔預估棗基因組大小的98%。同時把80%的序列錨定到了棗的12條假染色體上，註釋出棗基因32000多個。這些基因的獲得為棗後續的功能基因組學研究提供了大量的基因資源，為揭示棗特殊生物學性狀的分子機制奠定了基礎。
劉孟軍表示，棗全基因組測序的完成，標誌著中國在棗樹組學研究方面達到了國際領先水準，一舉跨入了世界果樹基因組學研究的俱樂部。該成果對推動世界棗功能基因組學研究、促進棗樹及其他果樹的遺傳改良和分子育種等將產生重大而深遠的影響，具有重要的學術價值和潛在經濟價值。 |
