表現出色的職業生涯和豐富的實戰經歷為阿奎利諾帶來諸多榮譽，他曾兩次獲得“海軍傑出服務獎章”、5次獲得“功績軍團獎章”、兩次獲得“銅星獎章”，以及“阿富汗戰功勛章”“伊拉克戰功勛章”“全球反恐服役勛章”“軍隊遠征勛章”“軍隊服役勛章”等。
阿奎利諾的任職涵蓋戰術崗位、軍兵種各級指揮崗位和參聯會不同聯合崗位，同時還有戰術教官等教學崗位，履歷豐富、資歷複合。其中，作為海軍專業人員最“硬核”的資質，是他長期擔任艦載機飛行員的資歷，並擁有飛行第三代、第四代戰鬥機和多次參加實戰的經歷。
航母打擊大隊是美軍的戰略機動力量，其主要戰鬥力即艦載機，艦載機飛行員在身體和反應能力等綜合素質要求方面甚至超過航天員，因而對世界任何國家軍隊都是稀缺和寶貴的人才。阿奎利諾的總計飛行時間達到5100小時，駕駛艦載機在航母上的攔阻著艦次數達到1150次。這一資歷和能力，在美軍高層指揮員中傲視同儕。
左右逢源的“鷹派”戰將
約翰·阿奎利諾被提名時的職務是太平洋艦隊司令。太平洋艦隊是印太司令部的海軍部隊指揮機構，司令部設在夏威夷的珍珠港，下轄美國海軍第3和第7艦隊。阿奎利諾於2018年5月17日從中央司令部海軍司令調任此職，接替太平洋艦隊原司令斯威夫特。後者因為第7艦隊所屬第15驅逐艦中隊阿利·伯克級導彈驅逐艦接連發生撞船事故，造成艦船嚴重毀損和17名水兵死亡，失去升遷機會而提前退休。當時，海軍中將阿奎利諾接任斯威夫特是由特朗普提名後獲國會聽證通過的。
特朗普在2020年11月3日美國大選開票顯示敗選之後反常操作，於11月9日宣布解除馬克·埃斯珀的國防部長職務，由美國家反恐中心主任克里斯托弗·米勒擔任代理國防部長。12月7日，美國代理國防部長克里斯托弗·米勒宣布：總統特朗普提名美國太平洋艦隊司令約翰·阿奎利諾上將擔任印太司令部司令，接任即將退休的菲利普·戴維森。
特朗普這種在已經明確敗選後更換國防部長和提名重要戰區司令的做法，無疑有“搶風頭”下先手棋、對下屆政府耳提面命的“越位”嫌疑。但是，新上任的拜登政府仍然提名阿奎利諾，這說明阿奎利諾在美國政治環境下，受到民主、共和兩黨的共同認可。
阿奎利諾左右逢源的原因，一方面是因為他的軍事專才得到美國政壇的普遍認可。事實上，美國新政府上任後，在戰區司令這樣重要的崗位人選上有自己的傾向和選擇並不奇怪，民主黨政府另選他人也不乏理由。在阿奎利諾任職太平洋艦隊司令期間，所轄第9航母打擊大隊的“羅斯福”號航母因新冠肺炎疫情蔓延，不得不中止任務停靠關島處置疫情，這直接導致美國海軍代理部長莫德利和“羅斯福”號航母艦長克羅澤爾去職。這一事件中，阿奎利諾是比海軍代理部長莫德利更直接的指揮官，不太可能完全沒有責任。
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