吸取了其它國家的經驗，例如美國，安倍主張建立一個日本版的“國家安全委員會”（National Security Council, 日本稱作國家安全保障會議）。日本安全理事會（Security Council of Japan）——一個由相關的內閣成員在日本遇到危機時向首相提供建議的權宜性機構——將被確立為正式機構。
而新國家安全保障會議的成員則會被限定於首相、內閣大臣、外相、防務大臣以及一些專業領域的相關大臣們。另外，在首相辦公室中，還將永久設立國家安全秘書處（National Security Secretariat）。國家安全秘書處會由一位具有豐富外交經驗的人來領導，其將率同60名來自諸多領域的安全專家，為日本國家安全戰略打下中、長期的政策基礎。而制定出來的國家安全戰略則會體現在綱領性的指導文件中，並頒發給日本各防務單位與外交官們。
像其它國家一樣，日本的外交、國防與警務機構之間也存在著相互“扯皮”的現象，這會對情報的整合與分析產生阻礙作用。但是，隨著國家安全保障會議的成立，每個部門和機構都會將重要的國家安全信息彙報給新的秘書處，而秘書處則負責將整合好的分析結果與事件報告成交給首相與其它領導人。
當然，也同其它國家一樣，官僚主義也是習慣的產物。就像我們已經看到的那樣，垂直整合的部門與機構所衍生出的障礙其實也並不容易克服。制度化是需要時間的——但一旦成功，其重要性不言而喻。
例如，新成立的國家安全保障會議將負責與其它國家共享信息，其中包括日本最為重要的盟友美國。這樣一來，信息的保密工作將至關重要，特別是日本政府還有向媒體洩露安全信息的老毛病。
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