然而，陳克明認為，深化兩岸產業合作是需要特定的外部（經濟以外）環境條件的。
他舉例說，兩岸產業合作需要兩岸企業之間有充分的互信，這也就需要兩岸企業之間要有良好的氛圍促進互信的不斷增強；兩岸產業合作的深化，不但需要兩岸經貿合作的制度化保證，還需要兩岸各自經貿政策、產業政策等方面的協調，這無疑需要兩岸官方當局的支持與合作。
“2016年台灣島內政黨輪替，兩岸關係出現停滯甚至倒退，兩岸關係的政治氛圍出現不利於兩岸和平發展的狀態，在兩岸關係有可能陷入對抗的情況下，兩岸經貿合作的轉型與深化的外部環境條件顯然不具備也不可能發揮積極的促進作用，這是兩岸經貿合作面臨的嚴峻挑戰的關鍵所在，” 陳克明說，特別是民進黨新執政當局不但推行在政治上拒不承認“九二共識”，推行“去中國化”，還在經濟上推行所謂的“新南向政策”，提出要“降低對單一市場的依賴”等等，不但不利於兩岸經貿合作的轉型與深化，實際上是在為兩岸經貿合作的轉型與深化製造障礙。
面對這種狀況，陳克明表示，大陸方面基於民族大義和造福於兩岸人民的宗旨，在堅持“九二共識”的原則的同時，強調繼續推動兩岸民間交流與經貿合作，應該說，不斷推進深化的兩岸民間交流和經貿合作，在一定程度上會有推動兩岸經貿合作的轉型與深化的作用。
“但這種作用是有限的，因為以兩岸經貿合作發展到目前的規模和水平，所面臨的困難和所需要解決的問題，沒有兩岸官方的介入和合作是無法在短期內推進和實現兩岸經貿合作的轉型和深化的。” 陳克明說。
他表示，在當今發展變化十分迅猛的國際經濟形勢下，不進則退，很容易就會喪失機會甚至於被淘汰，所以，兩岸經貿關係面臨的形勢是嚴峻的，這當然有可能會對兩岸經濟造成損害，而這種損害對台灣來說遠大於大陸，特別是台灣經濟一直處於低迷狀態，只要兩岸經貿關係受到影響，呈現走下坡狀態，台灣經濟進入衰退不會是危言聳聽的。
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