據悉，廣州大學-屏東大學的合作沿自1996年兩校的前身廣州市示範學院和屏東師範學院結成了兩岸公立高校間第一對姐妹校。此後兩校都經歷了合併升級,合作交流持續推進,廣州大學-屏東大學教育政策研究中心於2011年9月29日在廣州大學正式成立。與此對應，台灣屏東大學（原屏東教育大學）已先期成立“屏東教育大學-廣州大學教育政策研究中心”。根據廣州大學和屏東大學的協議，“廣州大學-屏東大學教育政策研究中心”屬於雙方聯合研究機構，其研究力量主要依託兩校教育學院、教育行政研究所、高等教育研究所師生，整合全校教育政策研究人員，以項目研究形式獲得研究中心支持，參與中心研究平台建設，共用研究資源，開展師生互換,分享研究成果。2014年，兩岸教育政策研究中心獲批為廣東省普通高校國際暨港澳台合作創新平台，以“粵台區域教育品質保障政策合作研究”為主題開展研究，取得了一系列研究成果。
為拓展學術研究視野，提升教育政策研究水準，加強兩岸教育政策研究人員的合作與成果交流，雙方商議設置“教育政策研究中心年會”制度，作為常設研究平台和交流機制，年會由兩校教育政策研究中心輪流主辦，迄今已成功舉辦九屆。
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