對相關事件所產生的兩岸效應，施威全表示，由於金廈水域本來就有高度兩岸政治性質，因此觀察兩岸官方的處置，無論在言語、行為上都有分寸，兩邊政府都有意識到，相關事件可以導致潛在的激烈衝突風險，雙方都不希望往這方面走。
他舉例，大陸方面雖然在事件發生後，公開否認金廈有“禁、限制水域”，大陸海警並隨即展開常態性巡查，並攔截金門觀光遊艇實施登檢，但相關舉措是在金門的“禁止水域”範圍之外，也就是說，海警船仍沒有進到“禁、限制範圍”。另外，雖然有大陸海監船進到“禁、限制水域”，但畢竟性質與海警船不同，是隸屬自然資源部，並不是人民武裝警察部門，非武裝船艦，且在台灣海巡警告之後，就退出界外。
施威全表示，上述情況顯示出，陸方的作為是非常仔細考量之下的行動；台灣方面也目前其實是重申法律立場，也沒有往前進一步，“海洋委員會”、“海巡署”都強調執法面，將焦點鎖定在執法意外，沒打算上綱到政治事件，陸委會也退居二線，台灣官方在相關事件上面無意去突出兩岸政治定位爭議。
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