據指出，大陸商務部台港澳司司長唐煒在協商過程中，曾經把商務部草擬的協議文本拿出來宣讀，內容包括序言、總章及其它各個章節，頁數長達六、七頁，雖然台灣經濟部也有準備文本草案，不過經濟部國貿局長黃志鵬當場表示，這次協商的範圍不包括文本內容，因此儘管大陸方面預先透露文本草案，但台灣這邊並沒有把文本草案拿出來。
台灣協商代表曾表示希望拿到唐煒手上的文本草案，但唐煒以還要拿回去修改為由，並沒有把文本交給台灣方面。
儘管兩岸都很有意願簽署協議，不過在談判桌上，雙方還是互有攻防，台灣主要希望大陸給予關稅減讓的待遇，大陸主要關切的是希望台灣取消對大陸農工產品的歧視性條款。
據轉述，唐煒對台灣限制836項大陸農產品及1300項工業產品進口，在會中表達不滿，認為兩岸經貿要正常化，台灣不能只對別的國家開放，卻獨獨對大陸不開放，當場要求未來在“海峽兩岸經濟合作架構協議”中，增列兩岸經貿正常化專章討論。
台灣代表團則努力解釋，強調不能期待一下子就解決所有問題，這個問題雖然必須面對、不能逃避，但目前只能彈性處理，兩岸談判才能往前走，否則你堅持你的，我堅持我的，談判無法進行。
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