保釣人士指美日安保條約已將釣魚台列嶼歸為日本所有，馬英九指出，美日安保條約認定很模糊，因為日本人說釣魚台是琉球的一部分，但我們說不是，我們認為釣魚台是在中日甲午戰爭後，日本人才竊佔，事實上歷史也是這樣。
他表示，1894年11月以前（甲午戰爭），清廷在海上、陸上都戰敗，日本的內閣會議在1895年1月通過將釣魚台劃入日本版圖，雖然是在4月17日簽訂馬關條約之前，但實際上很清楚的是在清廷戰敗之後。
他指出，日本過了7年後（1902年）才公布，完全違反日本政府作業的方式（明治憲法中規定，法令必須經過天皇飭令通過才可以生效具有效力，但關於釣魚台的事項，日本天皇並沒有發佈飭令，因此不具有法律效力）。
馬英九說，日本政府在兼併琉球時1875年先發布敕令（日本勒令琉球停止對中國的朝貢關係），等於總統府公報，這都很清楚，“所以我們適當的表達絕對是正當的，而且比日本、大陸都要早”。
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