馬英九表示，如果王郁琦當初沒任何處置，被反對黨、媒體發現，執政團隊會在什麼處境？王郁琦會被認為是疏忽或包庇，且一定會被追究包括前“國安會秘書長”金溥聰及他的責任。這是當初看到涉及洩密的資料後的研判，所以不能不採取必要措施，而且王郁琦的處置相對而言相當溫和，在公職生涯中這種例子很常見，就是先調離現職待調查清楚後確定沒有就還人清白。
對於王郁琦請辭職務。馬英九指出，當時是“立法院”有人問他如果張顯耀沒構成犯罪要不要下台？其實王郁琦在事發開始都表示是要“釐清一些疑點”對外不願說洩密，這種方式很溫和，沒說是匪諜、共諜，可是張顯耀一再在媒體上講說“陷害忠良”使得整個事情處理變得非常複雜；有民進黨人士覺得這案子如果不起訴會比較好，這種看法可能偏離司法與“國家安全”的主調。
有關陸客在台中轉、兩岸兩會協商前等資料洩漏，是否真的那麼嚴重？馬英九表示，詳細的部分最了解的是陸委會，都有將洩密公文，極機密、機密的清單逐項與檢方說明，可是檢察官認為不起訴處分書是機密不能公布，所以外界不清楚到底是那些事、有沒有構成洩密。
馬英九說，現在台灣的情治與他上任前很不一樣，他雖主張擴大、深化與大陸的交流，但“國家安全”不得不維護，公務員的公務紀律與保密規定絕不能違反，就像一方面與大陸謀求和平，另方面也要建軍備戰，不能因大陸和解、合作就放鬆戒備，身為三軍統帥當然要做好讓大家放心，所以王郁琦的處理是正確的，否則“國家安全”無以維護。 |
