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| 馬英九批准翁啟惠辭呈及信函內容全文。(照片:“總統府”提供) |
啟惠院長勛鑒：
貴院長自95年10月接掌“中研院”院長職務以來，致力提升國內學術研究水準，促進國際學術交流合作，至佩賢勞。
近三月來社會各界及“立法院”對 貴院長疑涉浩鼎案，極為關注。本（105）年3月28日晚英九接獲 貴院長自美來電話，擬以口頭方式請辭“中研院”院長職務，英九當即表示以越洋電話請辭如此重要職位，並不相宜，應以書面提出較為妥適；嗣3月29日復接 貴院長傳真辭職信函（如附件），有關請辭一事，英九業於3月30日批示：“中研院”為“我國”最高學術研究機關，其院長之進退，事關重大。請翁院長儘速回國向本人及“立法院”報告後再予處理，以維護“中研院”之聲譽並避免外界誤解。”本項批示經即傳真回復 貴院長，其旨在促請 貴院長身為政務官及機關首長，宜先回國向英九及“立法院”報告後，再由英九決定 貴院長之去留。貴院長當時已進入“請辭待命”狀態，諒蒙察及。
謹按 貴院長已於4月15日自美返國，先後於當日及25日兩次與英九會面說明浩鼎案疑義，復於4月18日及27日兩度赴“立法院”教育及文化委員會就浩鼎案提出專案報告並接受質詢， 貴院長諒已體察各界對浩鼎案及 貴院長去留之高度關注。
綜觀近日相關報道，各界對 貴院長因浩鼎案遭檢察官訊問、搜索引發之進退問題，多持“應辭職”之看法。諸如：“總統”當選人蔡主席英文認為“應尊重 貴院長辭職決定”、李前院長遠哲公開表示“應辭職接受檢調調查”、朝野政黨均認為“應立即辭職，靜候司法調查，讓國家最高研究機關盡快回復正常運作”、“立法院”教育及文化委員會跨黨派“立委”4月27日亦共同通過提案要求“立即辭職，靜候司法調查”等。貴院長4月25日與英九會面時，雖表示“此時辭職，將造成人事極大動盪，甚或影響“我國”際聲譽”，然則此一考量，顯係多慮。因此，英九為維護“中研院”聲譽，並在審酌各界期待後，決定同意 貴院長3月29日所提辭呈。貴院長請辭獲准後，英九將依機關政務首長辭職通例，立即留任王汎森、王瑜、王惠鈞等三位副院長，並指派其中一位副院長代理院長職務，以維持“中研院”正常運作，至下任院長產生就任為止，絕不致因 貴院長辭職造成人事動盪，尚祈釋懷。
至於 貴院新院長遴選過程中， 貴院評議會臨時更改《“中研院”評議會會議規則》中之選舉辦法，引發議論。此舉即便如評議會所言已行之有年，是否符合相關法規要求，仍然備受外界（含“立法院”）之質疑。針對此一疑義，“立法院”已決議要求本府與 貴院提出書面說明， 貴院實應適時釐清或補正。
此外，日前有三十餘位院士連署提出異議，認為現行由評議會遴選院長制度所引發之若干爭議，應予檢討，並建議下任院長應由預定本年七月舉行之院士會議遴選產生。但亦有數十位院士表達不同看法， 貴院亦應正視並研議解決之道。
至於 貴院呈報之新任院長遴選名單，英九在與候選人親自面談，並徵詢渠等對“中研院”未來發展抱負之前，不宜率爾為之。爰請 貴院儘速安排遴選名單上之候選人來府面會，以便英九或下任“總統”依法克盡遴選並任命新任“中研院”長之責。耑此，即頌
道祺
馬英九
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