林志嘉指出，台灣與中國談判的機會愈來愈密切，不論哪一黨執政，台灣必須要有一股非常堅定的主體性力量；民進黨要成為執政黨必須跨越50%選票，不太可能太強調台獨這塊領域，李登輝與台聯都認為，台灣與中國交流過程中，台灣主體性是最基本的、必須獲得保障，統獨統光譜也要很清晰。
他認為，主體性或獨派領域不會一下子成長很多，而是漸進式成長，台聯必須與民進黨分工。這是台灣主體性建構過程中必經的歷程，若缺少台聯耕耘“獨”的領域，泛綠陣營只剩下民進黨，對台灣發展並不好。
出身國民黨的林志嘉認為，李登輝因“國安密帳”案被起訴對藍營的影響遠比綠營大且微妙，馬英九本來尊李、現在變成打李，他的一些國民黨朋友有不少人對馬英九的作法很有意見，咸認馬做人不厚道，為了選舉對一位90多歲老人家開刀。整體而言，李案的氛圍對馬英九不利。
林志嘉觀察，執政者尋求連任有很大的優勢，正常情況下，應該主打政績，選戰常規，勝的一方不會主攻或用奇招、險招，必須用到奇招或險招正好顯示，選情處於弱勢。
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