早在2005年4月，時任中共中央總書記胡錦濤與國民黨主席連戰舉行的第一次“胡連會”上，國共兩黨共同發布“兩岸和平發展共同願景”，其中第二項就明確提出：“促進正式結束兩岸敵對狀態，達成和平協定，建構兩岸關係和平穩定發展的架構，包括建立軍事互信機制，避免兩岸軍事衝突。”
2008年5月國民黨上台執政，馬英九在當年的520就職演說中提出，將以“不統、不獨、不武”的理念，在“中華民國憲法”架構下，維持台灣海峽的現狀。他並提出要與大陸就台灣國際空間與兩岸和平協議進行協商。而在當年的12月31日，中共中央總書記胡錦濤發表題為“共同推動兩岸關係和平發展、同心實現中華民族偉大復興”的重要講話。這次講話第一次全面系統地闡述了兩岸關係和平發展重要思想，提出了推動兩岸關係和平發展的六項政策主張。其中第六項“結束敵對狀態，達成和平協定”中提出：“為有利於穩定台海局勢，減輕軍事安全顧慮，兩岸可以適時就軍事問題進行接觸交流，探討建立軍事安全互信機制問題。”可見，在兩岸關係和平發展開創期，國共兩黨和兩岸雙方都主張兩岸要和平，不要對抗，達成兩岸和平協議（定）是保持台海地區和平穩定，推動兩岸關係和平發展的重要舉措，而其中的重點就在於探討建立兩岸軍事安全互信機制。
然而馬英九在其第一任期內，不斷擴大對外軍購，特別是美國對台軍售達到新的水平。在其第一任內，美國曾三度向台灣軍售，總計金額達183億美元，不論是武器的質量和數量上都遠遠超過以往。馬英九在2012年的520就職演說中表示，將完善募兵制及相關配套，在“防衛固守、有效嚇阻”的戰略下，以“創新、不對稱”思維，建立量少但質精的武力。對於台美軍購，馬英九表示，“這讓我們未來擁有適當的防衛力量，使政府與人民更有信心與意願，繼續穩健發展兩岸關係。”顯然馬當局將美國的軍事支持與保護視為維護台灣安全和發展兩岸關係的重要支柱。而大陸方面則將維護台海安全和發展兩岸關係奠基於兩岸政治互信及建立軍事安全互信機制，謀求兩岸持久和平及穩定發展。2012年11月，中共十八大報告提出，希望雙方共同努力，“商談建立兩岸軍事安全互信機制，穩定台海局勢”。
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