雖然俄印兩國在武器裝備領域的合作非常密切，但是也經常出現一些問題，特別是印方時常批評俄制武器質量低劣，而且經常不按期履約。最受關注的爭議是原蘇聯“戈爾什科夫海軍上將”號航母改裝項目。蘇聯解體後，這艘1978年建成的航母被拋棄在俄羅斯北方機械製造企業船廠內，無法繼續值勤。2004年1月俄印簽署一攬子航母交易協議，俄方把這艘航母幾乎免費送給(以廢鐵價格折算)印度，條件是印方支付航母改裝費用，採購俄制新型艦載飛機和直升機，大約10億美元。再加上俄方培訓印度海軍人員、提供相應技術支持、建造航母基地基礎設施、轉讓技術文獻等費用，總計15億美元。但是，北方機械製造企業未能按照最初的合同期限在2008年8月交付航母，而且還要求印方追加數億美元改裝費。經過長期而艱難的談判，俄印直到2010年3月普京訪印時才就新的合同期限和條件達成一致，最終交易金額增至23.4億美元。俄海軍還要對改裝後的航母進行18個月的海試，預計直到2012年底才能交付印軍使用。不過，這個交付日期仍有可能再次推遲。而且也不能確保俄方能夠按期交付全部45架米格-29K/KUB艦載殲擊機。目前，在俄接受培訓的印度海軍航空兵飛行員正在駕駛米格-29K艦載機在俄軍“庫茲涅佐夫”號航母甲板上進行起降訓練。
俄專家擔心，雖然印度終歸會接收俄方改裝的舊航母，但是雙方圍繞航母問題產生的分歧和矛盾已經損害了俄軍工企業的形象，減少了俄方爭奪印度新武器訂單的機會。俄總統梅德韋傑夫2009年7月坦承，航母改裝事件使俄印關係受到了非常嚴峻的考驗。如果這個項目不能成功實現，將會造成嚴重後果。印度政府高官認為，採購一艘全新的航母，也比高價進口服役壽命有限的俄羅斯二手航母划算得多。
日刊稱，印度租賃俄羅斯“阿庫拉-II”級K-152“海豹”號核潛艇的合作項目同樣問題多多。印度支付上億美元換來了這艘核潛艇的10年使用權和人員培訓服務。俄方本應在2008年向印軍交付這艘核潛艇，但是因為各種生產問題而延誤。2008年11月甚至發生失火事故，造成20人死亡，多人受傷。交付日期再度推遲，至今仍未能履約。T-90S坦克許可生產問題同樣令印方極其不滿。2001年印度國產“阿瓊”坦克出現嚴重問題，隨後決定從俄羅斯採購300輛T-90S成品坦克。並且引進許可生產技術，計劃生產1000輛坦克。但是直到現在，印度僅僅生產了150輛坦克。印方指責俄方在技術轉讓和組裝配件供應上設置障礙，俄方百般辯解，指責印方推卸責任，轉嫁矛盾。 |
