北京軍區駐守京畿要地，肩負著守護華北門戶、保衛黨中央和首都安全的神聖職責。房峰輝擔任司令員期間，領導北京軍區的部隊持續開展實戰化訓練，全面提升信息化條件下作戰能力，先後參加上海合作組織聯合軍事演習、跨區演習等重大演訓活動，圓滿完成奧運安保、國慶閱兵、國際維和等重大軍事任務。其中，2009年10月1日陪同中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席胡錦濤檢閱解放軍及武警部隊，是房峰輝軍事生涯中最閃亮的時刻之一。這次閱兵的規模超越以往任何一次，參閱要素之全、裝備之多、兵種專業之廣，都是以往歷次閱兵沒有的。在這次閱兵後，2010年7月，房峰輝被授予上將軍銜。
近期，中日釣魚島爭端加劇，房峰輝在接受訪談時說：“近段時間，人們的目光紛紛轉向我國東海的釣魚島。大家關注釣魚島問題就是關注國家的主權、安全和發展利益。作為一名軍人，我也密切關注著事態的發展。黨和人民一旦需要，我們將堅決履行維護國家主權、安全和領土完整的神聖使命。”
2012年10月，房峰輝被任命為總參謀長。始建於土地革命戰爭初期的總參謀部，是負責組織全國武裝力量建設和作戰指揮的最高軍事統率機關。其主要任務是在總參謀長領導下，貫徹執行最高統帥和國防部長的命令指示，搜集和提供情報，擬定和組織實施戰略戰役計劃和動員計劃，指揮並協調各軍種、各戰區及各種武裝組織的作戰行動。2011年11月，總參謀部新成立了戰略規劃部，主管軍隊建設發展規劃。本屆總參謀部領導採用的是“一正五副一助”制，即一個總參謀長、五個副總參謀長和一個總長助理。
正是由於總參謀部的重要地位，總參謀長一職歷來備受關注，《大公報》網站稱“總參謀長是軍委主席的首席幕僚長，是負責全軍作戰、訓練的核心關鍵人物，必須有豐富的作訓管理經驗”，“此前幾任總參謀長張萬年、傅全有、梁光烈、陳炳德都曾有過至少兩個大軍區司令員的任職經歷”，房峰輝的出任“打破了多項紀錄”，“是20年來就職時年紀最輕的一位，只擔任過一個大軍區司令員”，“也是新中國成立以來首位晉升總參謀長的北京軍區司令員(楊成武曾任代總參謀長)”。
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