其次，軍隊規模結構繼續壓縮。目前俄軍已經放棄傳統的軍隊編制，初步實現向小型化快速反應部隊的轉變。改革前，俄陸軍主要由軍區、集團軍、師和團四級建制組成，改革後俄陸軍主要作戰兵團最高編制為旅。此外，軍隊總員額由104萬人削減到100萬人以下，國防部中央機關員額也由5萬多人壓縮到1萬人，實現了建立與國家經濟實力相適應的小型化軍隊的建設理念。
最後，俄軍後勤裝備體系初步形成。改革前，俄軍後勤與裝備部門林立，相互之間互不隸屬，給作戰部隊的裝備、物資和技術保障設置諸多障礙。隨著改革的展開，謝爾久科夫打破了後勤體系內部的壁壘，將裝備採購交國防部副部長負責，對無需軍人完成的保障任務全部由地方國防服務公司完成，實現了多種保障力量共存的局面。
雖然謝爾久科夫的軍隊改革措施使俄軍發展取得了一定的進展，但激進的改革方案也暴露出諸多的問題，在俄軍內外和社會各階層產生了一股強大的反對浪潮，此次他雖因腐敗問題下台，但其離職還包含了更深層次的原因。
第一，謝氏改革方案觸動俄軍內外各階層的實際利益，造成許多強力部門大權旁落。新一輪的俄軍事改革對國防部、陸、海、空軍種指揮機構進行很大的調整，使原有的指揮權被軍區的聯合指揮機構所取代，許多強力部門或者被裁撤，或者失去了往日的地位，因此，軍內高層對謝爾久科夫的批評不絕於耳，甚至上演了俄軍總參謀部主要領導“集體辭職”和軍官拒絕參加閱兵的事件。
此外，由於蘇聯解體後俄軍工企業科研生產能力急速下降，造成了軍工產品質次價高，謝爾久科夫一再威脅國內軍工企業要取消國內訂單，改從國外進口，這將使軍工單位失去豐厚的利潤，許多公司對他敢怒不敢言。
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