其次，要形成系統和科學的產業合作規劃。
兩岸經濟合作交流在相當長的時間是單向的，不對等和無序的。這主要是因為即使在經濟合作的高峰時期，雙方還是存在嚴重的政治對立和相互疑慮，具有主導優勢的產業資源基於經濟安全的考慮，很少能夠加入到經濟合作中來。“三通”遲遲不能實現，人員和物資交流的不便，也妨礙了台灣大批以現代服務業為主的優勢產業與大陸進行合作。兩岸缺乏產業規劃的無序經濟合作，也與大陸在那個時期對外資的來者不拒式引資方針有很大關係。
目前台灣和大陸的大量資源，包括資金和市場等已經相互開放，雙方也都在進行戰略性的產業提升和轉型，在眾多有合作基礎的領域，進行一體的產業規劃，會更加有效地提升資源使用效率，提升產業競爭力。兩岸將極有可能成為東南亞區域經濟中最重要的引擎。
進行產業規劃，首先應該側重於對兩岸經濟合作有重大影響的資源性產業。例如金融，兩岸應建立互信，共同保證兩岸經濟區的金融安全，保證台幣穩定，共同構建有效的投資融資體系，合力發揮兩岸巨額外匯儲備的優勢。又如，台灣是原材料相對貧乏的經濟體，限於經濟規模與一些政治因素，不可能制定資源開發和儲備的國家戰略，這也導致大批台資紛紛走出去以降低成本，造成台灣產業逐步空洞化；大陸在高速經濟成長中，也出現了工業原材料供應的問題，並已經啟動了原油礦石等國家開發和儲備戰略，但是受限於一些政治因素和國際經驗。兩岸攜手走出去開發海外資源，也是值得高度重視的方向。最後，特別應該注意到，由於兩岸近期開放三通和人員往來便利後，服務於兩岸間的資源深度互動和整合的經濟活動，相應地會催生出大量新興產業和企業，對這些產業進行整體規劃也是很重要的。
第三，要制定可行的投資計劃
台灣社會的民主制度和法制基礎，決定了其經濟實體的獨立性和自由度遠高於大陸，其經濟的開放程度也保證了其對國際規則的必須保持足夠的尊重。投資台灣，必須在充分尊重台灣現行經濟制度和經濟規則的前提下進行。這些制度和規則，也是大陸繼續深化經濟改革極為有益的參考。同時，也應該利用台灣“小政府大社會”的結構特點，放大發揮“民間力量”的作用，以有效規避有可能產生的政治摩擦對投資帶來的風險。
同時結合官方層次的經濟合作進行有效補充。如以大陸官方名義投資承建部分“愛台十二建設”等基礎項目，如高雄港、台中港、清泉崗機場、桃園機場等大型基建專案，高調支持馬政府的兩岸和解路線，幫助台灣社會改善民生，同時還可以提升三通的硬體基礎，並可以獲得一定的政治影響。
尊重國際規範，廣泛地參與國際經濟活動，也是大陸企業近年來需要學習和掌握的重要內容。儘管兩岸語言相通交流便捷，但通過合作學習積累國際經驗，也是在確定投資合作模式中需要重視的問題。如果策略得當，台灣企業有機會成為大陸企業的國際化進程中最好的夥伴和助力。
第四，投資產業重點
投資的方向，如前文所述，應優先考慮以下產業：
1、重點投資其金融產業和金融控股公司；構建可安全高效的金融服務平台；
2、合作構建面對海外特別是東盟和其他新興經濟體的海外產業平台；構建兩岸經濟持續發展的基礎，並大力拓展海外市場資源；
3、優先對兩岸互補性較強的產業進行投資；構建兩岸優勢產業的核心競爭力；
4、提升服務於人員物資往來的設施建設和流通服務業；提高內部經濟效率；
5、大力投資台灣教育文化產業和傳媒產業；伴隨華人經濟的高速成長，將中華文化發揚光大，也是兩岸華人共同的歷史使命，也是中華文化和傳媒產業騰飛的機遇。
第五，投資結構和途徑
目前台灣已大大放寬了陸資進台的限制。依據“大陸地區人民來台投資許可辦法”草案，同意大陸法人團體直接投資台灣陸資在台經營形態，可以獨資、合夥與直接投資台灣企業，或透過第三地來台投資，購買台灣公司股份或設分公司均可。而陸資認定的定義，也大幅放寬為持股50%以上，才視為陸資。
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