核查與透明。舊約包括詳細的數據交換、通報、12類現場視察、禁止遙測加密、在對方導彈總裝廠設點不間斷監視等措施。如今，俄羅斯傾向簡化條約規定的各種程序，減少入侵性核查措施。主要分歧有二：一是駐廠監視。二是禁止遙測加密。美國一直希望保留在俄羅斯沃特金斯克（Votkinsk）導彈總裝廠的駐點監視安排。俄新型導彈“白楊”和“布拉瓦”均在此組裝。俄羅斯曾在美國猶他州馬格納市的郝可留斯（Hercluels）導彈總裝廠設有監視點，後來因為美國沒有新型導彈開發，2001年俄羅斯單方面撤走監視小組。俄羅斯堅稱，如今美俄已不再是敵對關係，此類措施已不需要，美國繼續保留駐廠監視實質上是單邊的，也是不公平的。經討價還價，2009年12月後，美方在俄駐廠監視人員已撤走。
運載工具改裝。對削減下來的運載工具，美國計劃將其加裝常規彈頭，以提高全球快速打擊能力，因此主張在新約中不把常規運載工具部分計入限額。俄羅斯則認為，這些運載工具可重新裝載核彈頭，主張將其納入條約關於運載工具的限制總額內。就美國而言，戰略運載工具加掛常規彈頭是在布什任內做出的決定，美軍計劃到2015年形成這種常規力量投送能力，美國在這個問題上做出完全的退讓較難。雙方將就此達成妥協，即美國讓俄羅斯擁有相對多的運載工具，而俄羅斯同意美國改常規用途的運載工具排除在新戰略武器條約之外。
導彈防禦計劃。導彈防禦計劃不但影響到了新條約的達成，而且也影響到了美國和俄羅斯近年來的國家關係。俄羅斯一直認為，美國發展導彈防禦系統使美俄戰略力量對比失衡，兩國軍力差距進一步拉大。近年來，由於國力的變化，俄羅斯在客觀上增加了對核武器的依賴，一方面發展新型戰略運載工具，如部署陸基機動導彈“白楊”系列和發展新型戰略核潛艇；一方面在談判中將核裁軍與導彈防禦掛鈎。俄羅斯總統、總理、外長等在多種場合均強調美國導彈防禦計劃對裁減核武器的重要性，要求明確規定進攻性武器和導彈防禦之間的關係，確保美國的導彈防禦系統部署不要超過現有水平。但美國認為，新約主要處理戰略進攻性武器，導彈防禦問題應在其他場合討論。從現實情況看，奧巴馬調整東歐部署導彈防禦系統，把歐洲的導彈防禦計劃移到以海基為主的部署上，在國內遭遇批評。國會和軍方都不可能同意導彈防禦計劃接受任何實質性的限制。
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