俄羅斯高調反擊
隨著時間推移，越來越多的質疑和反思正在出現。
2004年，時值首個轉基因作物（西紅柿）獲准種植上市十周年之際，美國對轉基因提出第一次反省。美國國家科學院當時發布報告說，轉基因作物的種植和食用對人類健康、動物健康和生態環保已經造成危害或具有嚴重潛在的安全威脅，而目前、人類還沒有足夠科技知識能力預見、防治和彌補那些威脅或危害。
美國國家科學院的報告列舉了世界各地轉基因出現異常的試驗報告：食用了轉基因玉米的豬，在美國中西部農場出現假孕或不育；食用了轉基因玉米飼料的母牛，在德國實驗農場非正常死亡；食用轉基因飼料的雞的死亡率比使用自然飼料的死亡率高出兩倍；英國市場出現轉基因大豆食品後，居民的過敏症上升了50%，巴西出現同樣狀況……
美國國家科學院的報告引起世界反轉基因連鎖反應，2005年，俄羅斯公布了具有世界轟動性的轉基因喂養小白鼠的試驗報告。
這項試驗由俄羅斯著名生物學家伊麗娜.葉爾馬科娃主持，她發現轉基因食品影響小白鼠及後代的健康：在小白鼠交配前兩周以及在它懷孕期間，喂食經過遺傳基因改良的大豆，一半以上的小白鼠剛出生後就很快死亡，幸存的40%生長發育也非常遲緩，它們的身體都比那些沒有吃這些大豆的小白鼠所生下來的幼崽小。吃過這種的大豆的一些母鼠甚至不再有母性本能。
葉爾馬科娃認為，一些西方的大型跨國公司正將俄作為轉基因產品的實驗場。在俄羅斯加入世界貿易組織談判中，美國就直言不諱地向俄羅斯提出了開放轉基因食品市場的要求。她堅信，只要轉基因產品無害性還未被證明，那包括俄羅斯在內的世界各國所面臨的風險就會增加。
2006年，葉爾馬科娃走馬上任，當選為俄羅斯國家基因安全研究會副主席，俄羅斯拒絕向國民提供任何轉基因食品，嚴控轉基因食品的進入。
雲南財經大學社會與經濟行為研究中心教授顧秀林介紹：歐洲科學家早就知道轉基因食品對哺乳動物的危害，但是作為非主流，他們能做到的只是呼籲，因為孟山都的壓力無處不在。不過，在此問題上，歐洲政府正與美國“打太極拳”，等待時機。俄羅斯高調反對後，歐洲感到時機已到，一場反轉基因的風暴正在歐洲醞釀。
美國的底線
世界各國反轉基因的浪潮進一步影響美國，2008年，美國科學家證實了長時間喂食轉基因玉米的小白鼠免疫系統會受到損害，該研究成果發表在同年《農業與食品化學》雜誌上。同年4月，美國政府主管食品藥品的部門FDA宣布撤消它在數年前頒布的CRY9C轉基因玉米種植的工業指南，主要原因之一，就是該轉基因作物對人類健康安全有嚴重威脅。
此後，質疑轉基因食品危害的美國政府機構越來越多。不過，即便反對聲勢浩大，美國政府仍不打算放棄發展轉基因作物，並繼續支持轉基因種子公司向其它國家輸出技術。
值得關注的是，不管如何支持轉基因作物開發，美國政府始終有個底線：嚴防轉基因作物侵入現有的天然農業生產系統和天然食品供應系統。美國的天然農田面積遠遠超過轉基因農田面積，而且，轉基因農田大部分都是遠離天然農業和與世隔絕的新開墾田地。美國法規保障美國有足夠質量和數量的天然農田戰略儲備，即：一旦造成巨大危害而不得不放棄轉基因作物和現用農田，美國還有足夠的天然農田養活全體美國居民。
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