增值稅改革試點為何選擇在上海？選擇上海進行率先試點，得益於上海的財政承受力；上海國稅局與地稅局合署辦公，較少行政牽掣；較為成熟的稅收行政。另外，上海市地方稅務局在2010年發布了《營業稅差額徵稅管理辦法》，使得營業稅與增值稅的理論差距大為縮小。
增值稅改革試點從交通運輸業和部分現代服務業開展試點，取決於試點地區的產業發展規劃，也有技術上考量。交通運輸業目前徵收營業稅，稅率為3%。但交通運輸勞務與有形動產買賣通常是同一交易的構成行為，為主合同與從合同之關係，或構成同一交易合同的條款，《增值稅暫行條例》第八條對此特別處理，規定“購進或者銷售貨物以及在生產經營過程中支付運輸費用的，按照運輸費用結算單據上註明的運輸費用金額和7%的扣除率計算的進項稅額”。所以說，交通運輸業是營業稅徵收範圍中較容易與增值稅溝通的領域。增值稅的獨立性，依賴於增值稅專用發票而形成自我循環的封閉系統，拆除增值稅發票與營業稅發票的藩籬，逐步擴大營業稅發票在增值稅中的抵扣，實現發票的相互包容是兩稅合併的關鍵，當然這需要金稅工程的改進。
部分現代服務業試點範圍能放寬來看，將交通運輸業納入增值稅範圍，其相關聯的物流業、代理業等如果繼續隔離，則增值稅的效應將大打折扣。如果能將現代服務業試點範圍盡量放大，這既是增值稅中性的要求，也是對中國整體稅制改革規劃的需要。
文章稱，就大家關心的稅率變化而言，增值稅試點之前一般納稅人適用17%標準稅率及13%低稅率，小規模納稅人適用3%徵收率。本次增值稅試點在現行稅率基礎上新增11%和6%兩檔低稅率。此外，稅率還包括一般納稅人銷售自己使用過的物品和舊貨等，適用按簡易辦法依4%徵收率減半徵收增值稅；小規模納稅人銷售自己使用過的固定資產，減按2%徵收率徵收增值稅。增值稅稅率及徵收率較為多樣化。基於稅收中性與簡化目的，理論上一直提倡增值稅採納單一稅率，因為多重稅率影響法律中立、競爭中立與經濟中立。為增值稅改革的“軟著陸”，試點初期適用多重稅率兼顧利益平衡，但長遠看應合併減少稅率。
試點行業原營業稅優惠政策可以延續，並根據增值稅特點調整。現行營業稅的處理包括差額計稅，營業稅優惠包括減稅及免稅等。試點改革後仍然可採用差額徵收的辦法，原享受的營業稅優惠政策也可實行平穩過渡。同時，試點改革後的增值稅優惠包括適用低稅率、即徵即退等。增值稅不鼓勵減免稅方式優惠，因為會導致增值稅抵扣鏈條斷裂，而且免稅不能開具增值稅專用發票。
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