“教育部”國教院不同意的意見如下：
（一）於涉及鄭成功統治台灣時期，我等教科書所統一使用的詞彙為“明鄭”時期，審定委員會對此一用語認為違背課綱，不得使用，應統一稱為“鄭氏統治時期”。
（二）於提及日本統治台灣時期，我等教科書所統一使用的詞彙為“日據”，審定委員會對此一用語認為違背課綱，不得使用，應統一稱為“日治”、“日本統治”或“日本殖民統治”。
（三）我們提及“台灣在鄭成功之後逐漸轉變為以中華文化為主體的社會”，審定委員會卻認為“整體而言，課文似乎過度強調台灣以中華文化為主體之結構，此一論述具爭議性，請再加以斟酌”，並要求改正，希望我們強調“台灣是以多元文化為主體”。
（四）審定委員會對於教科書大事年表以“本國史”與“世界史”作區隔有意見，而希望採其它教科書以“台灣史”、“中國史”、“世界史”的方式來分類。
（五）審定委員會對於教科書使用“中共”一詞有意見。希望我們用“中華人民共和國”。
（六）審定委員會要求教科書依照課綱規定使用的詞彙。
我們的看法
本人所屬出版社曾向國教院審定委員會做以下的解釋：
（一）為何使用“明鄭”？我們認為：“鄭成功在政治上以明朝之一部分自居，奉南明永曆帝為正主，以永曆為年號。明永曆帝賜鄭成功的封號為延平郡王，鄭成功死後由鄭經與鄭克塽自行襲位，亦一直使用‘永曆’年號至永曆37年降清為止。坊間雖有以“鄭氏王朝”或“東寧王國”稱之，惟以姓氏或地名稱呼王朝非歷史的正式稱呼，“我國”歷史向來重視正統與名份，因而史界多以“明鄭時期”稱呼鄭氏三代在台灣的經營時期，以符合與尊重鄭氏家族對自己史觀的認定”。以上是我們回覆的意見，但是“教育部”國教院不接受我們的說法。
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