他的頂頭上司艾吉中校，有一次在他的桌子上發現“一堆”與他職責無關的最高機密文件。1985年10月的一個星期五傍晚，波拉德的一位同事發現他攜帶了一個大紙袋離開了大樓，這名雇員將這一情況向上司作了報告。
情報中心迅速展開調查，發現那一紙袋文件是電腦中心有關中東地區來往函電的記錄。於是艾吉中校在暗中加緊對波拉德的監視，發現他在以後的兩個星期五，帶出去更多的機密資料。艾吉中校立即將此情況向安全機關作了報告聯邦調查局和海軍調查局的特工為了取得證據。聯邦調查局和海軍調查局開始對其進行調查，在其辦公室暗置微型攝像頭。11月18日波攜文件出辦公樓時被截查，導致他供認向以提供大批文件。21日早晨，波拉德逃脫了監視，突然開車進入了以色列駐美國大使館，要求政治避難。但10分鐘後，以色列使館人員將波拉德送出了使館大門，守在使館門外的聯邦調查局人員立即逮捕了波拉德。1987年3 月美國地方法院宣判波拉德終身監禁。
4、間諜案傷了鐵杆盟友間的感情
波拉德案令美國嘩然，時任總統里根怒斥以色列忘恩負義，國防部長溫伯格稱，波拉德對美國家安全的損害無以複加。美中情局深感恥辱，宣布中止與以色列情報機構摩薩德合作，要求按叛國重罪判波拉德死刑。
此案還牽涉多個美國的阿拉伯盟國，阿盟抨擊美國把阿拉伯國家情報出賣給以色列，損害了阿、美防務合作，危害美國在中東的戰略利益。許多美籍猶太人紛紛表白“首先是美國人，然後才是猶太人”。摩薩德的海外行動受影響，其陰影延續多年。波拉德案後，美更加嚴防猶太“鼹鼠”。1996年，以色列授予波拉德以色列國籍，並在1998年首次承認他是以色列間諜。此前，以色列一直否認曾向波拉德支付酬金換取情報。此後數十年來，以色列方面不遺餘力地營救波拉德，多次要求美方將其釋放，甚至以拒絕在巴以和平協議上簽字相要挾，但營救均未成功。
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