而在养老保险缴费方面，实施並轨改革后，要求事业单位人员所在单位缴纳20%的基本养老金和8%的职业年金，个人缴纳8%的基本养老金和4%的职业年金，这方面与公务员也是基本一致的。
但硬币的另一面是，实施机关事业单位工资、养老保险两项制度改革之后，中央和地方财政的负担明显加大。以养老保险为例，机关事业单位提前缴纳的20%基本养老金、8%职业年金，大部分来自财政，由於事业单位人员数量较大，相应的财政负担也就更大。
前述接近人社部专家研究发现，在新一轮事业单位改革之前，全国事业单位经费大约有60%是来自财政全额拨款、20%是来自财政差额拨款，综合起来，每年国家对各项事业经费支出占到整个政府财政支出的30%以上。实施事业单位人员工资调整、养老保险並轨两项改革之后，从中央到地方财政，预计对事业单位的支出还会节节攀升。
下半场
在新一轮事业单位改革中，官方设定的期限是2020年。但大多数社保专家认为，从目前的情况看，下一步需要解決的事业单位改革中的问题还有很多。
首先是从事生产经营活动事业单位的“转企改制”问题。前述接近人社部专家告诉经济观察报，这方面虽然涉及的单位数量不大，人数相应较少，但由於在改革过程中，转制单位需要经历的程序很多。
比如，要按规定进行单位资产清查、财务审计、资产评估，核实债权债务，界定和核实资产，还要注销事业单位法人，核销事业编制，进行国有资产产权登记和工商登记，並依法与在职职工签订劳动合同，建立或接续社保关系。
因此，为了实现平稳转制过度，有关方面给予从事生产经营活动事业单位的“转企改制”过渡期限较长，一般为5年。在5年的过渡期內，对从事生产经营活动事业单位的“转企”单位，还给予保留原有税收等优惠政策，原有正常事业费还会继续拨付。
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