這次公投法初審，總共有四項公投門檻被大幅降低：
一、降低公投提案門檻：從最近“總統”選舉人數千分之五降為萬分之一，只需要1800人連署即可提案。
二、降低公投連署門檻：從原本5%（93萬人）降為1.5%（28萬人），連署期間六個月，要求主管機關建置電子系統，投票人可使用自然人憑證進行電子連署。根據“內政部”統計，截至12月16日，領有自然人憑證的公民，已經高達550萬803人。
三、降低公投通過門檻：從原本“雙二一門檻”（投票人數超過選舉人數二分之一、同意票超過投票人數二分之一），降為“同意票超過不同意票，同意票超過選舉人數四分之一”，亦即不再需要930萬人投票，只需要465萬人投票即可過關。
四、降低公民投票年齡：從原本20歲降為18歲。
更重要的是，公投法初審還決議廢除設置“公投審議委員會”，將主管機關改為“中選會”，未來“中選會”對提案不再具有核准權，只能修正提案文字，不能修正提案內容，亦即只要提案和連署通過門檻，只要提案屬於公投範圍，不管提案內容為何，政府就要配合舉行公投。
顯而易見，大幅降低門檻的公投法，由於可行性大幅提高，將成為在野勢力擴大民意動員的超級武器。尤其是指向選舉競爭的在野黨，更可透過公投提案，利用6個月公投連署，與執政黨展開針鋒相對的文宣造勢，即使最後未必能夠通過四分之一門檻，也可讓選民留下深刻印象，不但可強化在野黨的政策定位，同時也能進一步擴大爭取選民。
對國民黨來說，在林全院長暫緩日本福島五縣市食品進口之後，最可能發動的公投提案，恐怕是反對瘦肉精美豬進口。12月8日特朗普總統交接團隊顧問葉望輝（Stephen Yates）訪台，就提醒“特朗普在經貿談判上，可能會相當強硬，台灣應做好準備”，明年1月20日特朗普總統上台之後，要求台灣“開放瘦肉精美豬進口，否則免談台美TIFA，更不用談台美FTA”的壓力，勢將紛至沓來。
2012年台灣每人豬肉年消費量高達37.3公斤，遠高於牛肉消費量4.9公斤，豬肉消費量將近牛肉7.6倍，加上台灣民眾愛吃豬肝等內臟，瘦肉精殘留量顯然更高，也難怪反對瘦肉精美豬進口的民調始終居高不下。2016年6月2日，TVBS民調顯示，高達73%民眾反對開放含瘦肉精的美豬進口，即使是民進黨認同者，也有高達72%反對進口。
可想而知，一旦在特朗普上台之後，不斷傳來美國要求台灣開放瘦肉精美豬進口傳聞，國民黨早晚必將提出“是否開放瘦肉精美豬進口”的公投提案，試圖藉此鞏固泛藍選民，進而爭取中立選民，乃至分化泛綠選民，讓民進黨陷入左右為難的執政困境。2012年5月20日馬英九連任“總統”之後，就曾因為想立刻開放瘦肉精美牛進口，導致民調大跌，如今蔡英文政府遭遇比瘦肉精美牛更具有破壞威力的瘦肉精美豬，政治衝擊恐怕只會更加狂烈。
問題是，以特朗普的強勢領導作風，一旦“反對瘦肉精美豬”成為台灣公投提案，進而展開為期6個月公投連署，台美關係恐將陷入空前危機，“農委會”和“衛福部”能否及時強化食安管理，讓民眾改變既有成見，無疑為一大挑戰。
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