從1996年開始，日本開始改革冷戰時期確立的陸上自衛隊“13師2混成旅”編制進行改革，并於2009年度完成并確立“9師6旅”的編制，形成由政經中樞、沿岸部署、戰略機動等多種類型師、旅組成的陸上自衛隊。
2006年度末，日本在朝霞基地新編中央快反集團。該集團由日本防衛大臣直接管轄，是一支具有戰略預備隊性質的快速反應部隊，總兵力約4500人。中央快速反應部隊有“自衛隊味精”的綽號，因為它整合了陸上自衛隊幾乎所有能第一時間出動的精幹力量。
後來又經過幾次整編，至2013年度末，陸上自衛隊形成了8個普通師、1個機動裝甲師、6個旅、5個混成旅和中央快反集團的編制。其中，中央快反集團和1個裝甲師為機動作戰部隊，其餘8個師和6個旅為平時固定部署部隊。
2013年的新防衛計劃大綱提出，日本將在陸上自衛隊中設置新的司令部——“陸上總隊”，以統領陸上自衛隊北部、東北、東部、中部、西部五個方面隊（相當於軍區），屆時“中央快反集團”將撤編，轉隸至“陸上總隊”。同時對目前的兵力結構進行調整，形成由3個機動師、4個機動旅、1個裝甲師、1個空降旅、1個直升機旅和1個水陸兩栖機動旅組成的“機動作戰部隊”，其餘5個師和2個旅作為平時固定部署部隊。其特點是加強機動作戰力量，同時保持和軍區的地域守備力量，形成地域守備和機動應變的雙型部隊配置。目前，這項改革尚在進行中。
建立聯合作戰體制，與美軍無縫對接
美國、俄羅斯等國家在軍事轉型中相繼建立了聯合作戰指揮體制。日本作為美國的重要盟友，在指揮體制上也追隨美國，逐步建立起既適合本國國情，又方便與美軍對接的聯合作戰體制。
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