99式坦克實現了火力、機動力、防護力和信息力的綜合協調發展，實現了我國坦克裝甲車輛技術的跨越式發展，在主戰坦克領域與當前世界先進水平真正站在了同一個起跑線上，為實現我軍機械化、信息化複合發展奠定了重要的物質技術基礎。
在火力上，99式坦克採用自行研製的125毫米滑膛炮，這種全新設計的坦克炮製造工藝先進、性能優異，可發射尾翼穩定脫殼穿甲彈、破甲彈和榴彈等不同類型的坦克炮彈，還可發射激光制導炮射反坦克導彈系統，反裝甲目標作戰能力顯著提升。同時，99式坦克採用了自動裝彈機，使坦克乘員數量從4人減少到3人，並大大提高了坦克炮的戰鬥發射速率。
在機動力上，99式坦克較前兩代國產坦克大為改進。其動力裝置採用先進的國產柴油發動機，吸納了從國外引進的先進技術，性能穩定可靠，最大輸出功率1200馬力，改進型進一步提升到1500馬力，單位重量功率達到了世界先進水平。
99式坦克的傳動裝置、操縱裝置、機動裝置等都是全新設計的，傳動效率高、操縱靈活簡便，啟動快、加速快，高速行進時懸掛、減震效果好，徹底改變了老式國產坦克在機動性方面的落後狀況。
在防護力上，99式坦克進行了綜合防護性能的全新設計和重大改進。除改良裝甲提升車體防護性能，99式坦克摒棄了國產坦克傳統的俄式鵝卵型鑄造炮塔，採用了西方式的焊接炮塔以增強防護力。99式坦克炮塔的基礎裝甲為陶瓷複合裝甲，在後續改進中又在炮塔正面和尾倉兩側的護欄上加裝新型反應式裝甲，進一步強化了裝甲防護能力。炮塔後部安裝了激光壓制系統，可干擾敵方激光測距儀的工作或致盲敵方觀瞄射手、步兵。
99式坦克安裝了先進的車內自動滅火抑爆系統和三防系統，其自動滅火設備對車內火源的反應時間小於0.1秒。這是在其研製過程中充分吸納了外軍實戰的經驗教訓。在上世紀90年代的車臣戰爭中，俄軍T-80坦克中彈後非常容易引燃車內彈藥而產生殉爆，其中最重要的原因就是俄制坦克不重視二次防護能力，其自動滅火系統能力欠佳。
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