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| 兩岸統合學會“一中三憲，兩岸統合”的主張，在會上引發許多討論。 |
第一個層次，在原則性問題上，大多數學者都共同主張，雖然它不該是統一協定，但應該要體現一中原則，只是表述上可以更為技巧。而由兩岸統合學會所提供的一份草案，有學者認為從“互相承諾不分裂主權與領土”上說，已經相當技巧，當然也可以再謀改進。整體而言，有關和平協定的問題，兩岸學者在原則問題上，還是有著相當共識的。
第二個層次，對於和平協定究竟該分步走，還是將“結束敵對狀態”與“開啟和平發展的途徑”兩個部分放在一起，有不同的看法；但無論分步與否，多數學者還是主張應該納入結束敵對狀態，也應該要能指引和平發展的願景與途徑，亦有人主張應納入軍事互信機制。
第三個層次，則是法律層次的立法技術問題。這部分包括其法律位階、締約主體、效期、監督機制等等，顯然還在很初步的討論階段。大多數與會者認為，未來兩岸和平協定的性質，應該還是偏重在政治性的法律文件。
在此次會談的尾聲，全國台研會副會長許世銓對整個會談做了一個十分精闢的概括，他表示，此次會談以“兩岸和平發展路徑”為主題，是非常具有意義的。兩岸今天的當局都追求和平發展，但和平發展的過程，對大陸而言乃是“過程為了目的”，可是台灣卻是“過程決定目的”。為了不要在追求和平發展的過程橫生枝節，兩岸有必要尋求“後九二共識的論述”，以儘速建立政治協商的基礎。
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