政府如何做好自身改革的問題，是政府的自我革命問題，在現階段情況下，改革的許多難題都是和政府牽涉在一起的，有些問題從根子上來說就是由政府職能不當引起的，因此，要實施好改革首先就要做好政府改革，這是改革的第一塊，也是最大的一塊硬骨頭。
第二，政府公職人員的觀念轉變。政府和公職人員的關係是不可分割的，在政府進行自身改革的同時，具體行使政府權力和承擔政府職責的公職人員也需轉變觀念，否則，政府職能轉變就可能難以取得成效，公職人員也可能出現阻擾、破壞政府職能轉變的現象。
中國是一個擁有2000多年封建歷史的國家，在漫長的歷史中公職人員形成了封建主義的官僚思想，官老爺作風濃厚，至今，這種作風在社會上還比較常見。典型的事例是，去年以來中央實施了八項規定，在這一規定下，不正當的吃喝、送禮和福利都減少了，但有些公職人員反而覺得逢年過節沒有福利、沒有禮品不正常，甚至覺得過年還要自己掏錢買水果非常委屈。這樣的觀念必須轉變，否則政府職能轉變就可能成為一句空話。
轉變公職人員的觀念是一個非常難的問題，觀念作為社會現實的反映，要轉變觀念首先得改變社會現實，改變那種公職人員高高在上、權力不受制約、不送禮不請客就辦不成事的社會現實，同時加強制度建設和社會監督。這是改革的第二塊硬骨頭。
第三，處理政府和市場的關係。在轉變了政府職能後，才有條件來談發揮市場在資源配置中的決定性作用，也才有可能真正發揮好市場的作用。在政府與市場的關係方面，除了政府如何規範市場運行、如何改進審批制度等外，最為核心的應是國企與民企的關係問題。
國企是政府參與市場活動的代言人，許多國企的行為都是在政府直接指導下作出的，因此，要限制政府對市場的干預，就得限制國企破壞市場經濟的行為，特別是壟斷、補貼等行為。另外，要處理好國企和民企的關係問題，要真正做到讓民企進入傳統國企的領域，做到國企和民企平等競爭。這是改革的第三塊硬骨頭，這塊硬骨頭也可能是利益集團阻擾最多的硬骨頭。
第四，處理政府和社會的關係。在目前，如何發揮市場的作用各界討論較多，也有比較成熟的想法，但對於如何發揮社會的作用，則相對關注較少。實際上，政府職能轉變，除了要減少對市場的干預外，還包括減少對社會的干預，充分發揮社會的作用，實現社會自治和社會的自我管理。
問題的關鍵是，文革之前，中國基本是國家完全壟斷了社會管理，社會沒有獨立性，雖然經過三十多年的改革開放，社會部分獨立了，也有一些環保、公益方面的社會組織成立，但社會依然沒有自我管理的經驗，如果政府職能從社會領域退出，社會能否較快的接手？能否做好自我管理？政府又如何對其進行規範和監督？這些都是新問題，都需要改革者提前思考和必然會面對的問題，這是改革的第四塊硬骨頭。
第五，如何調整、平衡各方利益。很多改革之所以成為難題，成為硬骨頭，就在於其牽涉多方利益，涉及人員也非常多。處理好這個問題非常考驗改革者的智慧。
利益相關方可以分為幾個層次：一是利益受損方，二是得利方，這個利益是合理的，三是不合理利益的得利方，四是利益集團，在改革中要理清這幾方面的關係，在維護利益受損方的同時，也不能減少得利方的合理利益，同時又要做好不合理利益被取消後，相關人員的安置工作。就拿醫改來說，醫院以藥養醫雖為社會詬病，但這裡面涉及到了醫生、醫務工作者對自身合理利益的訴求，在取消以藥養醫的同時，要考慮到如何彌補由此帶來的醫生、醫務工作者的利益損失。
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