在襲擊事件爆發後，巴基斯坦迅速採取了一系列反制措施，其中以切斷境內北約通往阿富汗的運輸補給線最為引人關注。眾所周知，駐阿富汗聯軍的軍用物資有兩條運輸通道：從巴基斯坦卡拉奇港通過西北部開伯爾-普什圖省的開伯爾山口運抵阿富汗；從中亞的軍事基地繞道運抵阿富汗北部。目前，巴基斯坦通道承擔了大部分運輸任務，被外界稱之為北約駐阿聯軍的“生命線”。
如果巴基斯坦切斷該線，美國只能通過中亞運輸線或者空投保證物資供應。但這兩種方式都缺乏可行性。首先，中亞線路通過美國在中亞的軍事基地（馬納斯空軍基地）補充物資。這面臨兩大難題：物資供應量少，遠不能滿足駐阿聯軍的需要；該線運輸路途遙遠，既不經濟也耗時。其次，阿富汗地形複雜，群山環繞，氣象、地理條件都極為惡劣。因此，如果採取空投將受到地形、氣候的極大影響。此外，空投的物資量少，遠不能滿足駐阿聯軍的實際需要。因此，如果巴基斯坦長期切斷該線，駐阿富汗聯軍的物資供應將遇到嚴重困難，這對於美國在阿富汗的軍事行動將產生嚴重的、直接的影響。
此外，巴基斯坦還要求美國撤離位於西南部俾路支省的舍姆西空軍基地。該基地是美國在巴阿邊境地區發動無人機空襲的重要基地之一，在打擊巴阿邊境地區恐怖分子的戰鬥中功勛卓著。如果美國撤離該基地，其無人機的後勤補給將不得不遷至阿富汗境內，而阿富汗境內尚難建立如此規模的無人機空軍基地，況且將無人機基地建在阿富汗將使得基地面臨恐怖分子襲擊的巨大風險。如此一來，美國無人機對巴阿邊境恐怖分子的打擊力度將大大降低，其以打促談的政策方針恐難落實，恐怖分子也將由此獲得難得的喘息之機。
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