由於歷史沿革和體制原因，民間智庫一直是我國智庫發展中的“短板”。民間智庫儘管近年來有所發展，但在經費保障、項目來源、成果上呈通道、建言獻策平台上先天不足，患上了“侏儒症”。“用魚龍混雜來形容當下的我國民間智庫，並不為過。”國觀智庫創始人任力波指出，“現在的民間智庫，有很多以前是咨詢公司、調查公司、信息公司，他們現在都在開展智庫發展計劃，其中既有實質業務上的轉型，但也有很多是提法上的噱頭。”
影響力是智庫發展的關鍵所在。王榮華指出，“我國智庫中，關注國家發展層面問題的智庫影響力會更大一些，關注區域層面問題的地方智庫的影響力則相對較小。”此外，我國智庫主要聚焦於經濟政策、政治建設與國際問題研究，專業化分工相對不足。這也是我國智庫發展的階段性特征。
成長中的煩惱
不可否認，我國智庫已進入一個快速發展期，有力推動了我國公共決策的科學化與民主化進程。可若認真給我國智庫發展把把脈，存在的問題也不容忽視。
一是“近”與“遠”問題。當今中國，活躍度高、影響力強的智庫以官方或半官方為主。這些智庫與決策機構距離“近”，成果能快速被應用到公共政策中。但走得太近，就存在缺乏公信力、難以形成“獨到見解和意見”的危險，與公眾距離容易“遠”。錢由上級給，承擔人是圈定的，再加上項目結項也常由政府部門來組織，“這樣的智庫充其量只是個‘幕僚’的角色，很難保證其獨立性、客觀性、社會性和創新性”，國家教育行政學院社會科學教研部副教授胡銳軍指出。因此，如何保持“近”與“遠”的平衡，是我國智庫發展要嚴肅對待的問題。
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