第二，如何保障出高質量的研究成果，對政策產生影響？這就需要明確高校內的智庫的具體運行模式。這裡涉及到人才、經費來源、研究成果的傳播途徑等。
關於人才，高校，尤其是著名大學，有很多著名學者，這是高校很重要的智力基礎。高校是人才流動、思想交匯的場所。說到底思想庫或智庫，就是需要智力和思想不斷碰撞交流，高校在這一點上有得天獨厚的優勢。
關於經費，目前我國對政策研究尚未有完善的資助機制，在一些情況下，政府沒有足夠的經費來支持專業智庫做較為重要的政策研究。而在高校的主業是培養人及做基礎研究，所以高校已經承擔了做政策研究所需要的很多基本投入(如圖書資料，基本辦公設施等等)，也就是說學校已經把很多固定成本覆蓋了。這樣，相對於其它智庫來說，高校在經費方面也有一定的優勢。
關於研究成果的傳播模式，實際上許多政策研究成果可以通過公開渠道去影響社會各個方面，最終影響決策。但在一些特定情況下許多政策研究涉及敏感課題和分析，這種情況下與決策部門的直接溝通渠道比公共渠道更有效。所以一個機構內部是否具備這種渠道以實現有效的政策溝通很重要。
以清華大學公共管理學院為例，學院是清華大學很多重要智庫的機構平台，其中包括清華大學國情研究院、清華大學中國農村研究院、中國科技政策研究中心、中國發展規劃研究中心、中國工程科技戰略發展研究院等。這些智庫有不少都是與相關的部委，如科技部和發改委等聯合成立的。這種合作共建的模式可以保證其研究成果能夠比較暢通地向決策者傳遞。
第三，涉及到治理結構。高校裡的智庫在組織架構安排上是否具有獨立於智庫運行之外的機構，例如理事會，來監督智庫的運行，評估其績效，保障其質量，並根據社會環境的變化為智庫的戰略發展提供咨詢建議。在中國，相當一部分智庫都有這樣的理事會，但是並沒有真正發揮其應有的作用。要保證這樣的機制對高校智庫的治理髮揮作用，很重要的一點在於高校內智庫的領導者是否真正認為這個機制很重要，願意推動其發揮作用。
完善智庫治理結構 建立公開透明機制
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