10.關於部分二級單位黨組織長期不健全，18個派出機構目前還有7個黨組領導班子成員人數不到3人問題。
按照《中國共產黨黨組工作條例（試行）》《黨政領導幹部選拔任用工作條例》規定的標準、程序和環節，逐步配齊派出機構黨組領導班子成員。目前正對7個派出機構黨組成員動議人選履行提拔程序。
11.關於直屬機關黨委、機關紀委處室設置不完善，群團建設不力。直屬機關黨委、機關紀委處級領導幹部配備未完備問題。
重點抓好以下整改工作：增設機關黨委群團工作處、機關紀委紀律審查室，選配了群團工作處處級領導幹部。印發了《中共國家能源局黨組關於加強和改進黨的群團工作的實施意見》，確定機關團委書記、副書記候選人，擬於8月召開國家能源局第一次機關團代會，選舉產生國家能源局直屬機關團委。積極推進機關工會籌備工作。
12.關於派出機構黨組設立有待規範問題。
按照《中國共產黨黨組工作條例（試行）》規定，擬將派出機構黨組改設為分黨組，已向中央有關部門請示，目前正在履行報批程序，待中央有關部門批覆後立即整改到位。
13.關於基層黨支部不健全問題。
重點抓好以下整改工作：已轉發《中共中央組織部關於在“兩學一做”學習教育中對基層黨組織按期換屆情況進行專項檢查的通知》。截至2016年7月底，已有9個直屬黨組織完成換屆選舉工作，所有直屬黨組織都已建立紀檢機構或配齊紀檢委員。
14.關於十八大以後，被查處的8名司處級幹部都存在“帶病上崗”問題。
重點抓好以下整改工作：全面梳理倒查8人選拔任用過程，認真總結汲取教訓。嚴格執行《關於加強幹部選拔任用工作監督的意見》，堅決做到幹部人事檔案“凡提必審”、個人有關報告事項“凡提必查”、紀檢監察部門意見“凡提必聽”、線索具體的信訪舉報“凡提必核”，把好選人用人質量關。進一步加強制度建設，研究制定局黨組《關於防止幹部“帶病提拔”的意見》，9月份出台。
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