多個省份均在召開的全省機構改革部署會議上強調“堅持和加強黨的全面領導”，例如在2023年12月27日召開的湖南全省機構改革動員部署電視電話會議上，湖南省委書記沈曉明指出“本輪機構改革是堅持和加強黨的全面領導的制度安排，是解決深層次體制機制問題的重要舉措”，而在1月3日召開的江蘇全省機構改革動員部署會上，江蘇省委書記信長星則指出要“把加強黨的全面領導作為主題主線”。
中央黨校（國家行政學院）公共管理教研部副教授張克在《新一輪地方機構改革的理論邏輯與重點任務》一文中指出，堅持和加強黨的全面領導是新一輪黨和國家機構改革的統領性邏輯。推進地方機構改革要把堅持和加強黨的全面領導作為首要任務，堅持貫徹《方案》對地方機構改革提出的明確要求，從體制機制上對地方層面全面加強黨的領導作出制度安排，從機構職能上把加強黨的領導落實到各領域各方面各環節。
黨的十八大以來，我國一共進行了三次機構改革。根據中國人民大學公共管理學院教授何艶玲在《“體系化”：新時代機構改革的特質與邏輯轉換》一文中的梳理， 2023年機構改革在鞏固前一階段機構改革成果的基礎上，聚焦國家科技攻關、防控系統性金融風險、數字治理等重大戰略領域，進一步對體制機制和機構職責進行調整和完善。儘管2023年機構改革僅涉及49個部門，但更強調縱深改革，集中體現在理順關係上。
何艶玲對《中國新聞周刊》指出，早期的機構改革，主要目的包括機構和人員精簡、減少財政損耗、減少行政成本，新一輪機構改革強調“堅持和加強黨的全面領導”，這從機構改革的角度來看，是通過黨的領導構建一個更高效的體系，從而實現以人民為中心的治理。何艶玲認為，本輪機構改革呈現出“體系化”的特點，而不只是簡單的加減法。
根據《方案》，黨和國家機構改革的重點領域包括社會工作、科學技術、金融監管、數據管理、鄉村振興、知識產權、老齡工作等。從各省的機構改革部署會議來看，這些領域也是本次地方機構改革的重點。
中央黨校（國家行政學院）教授、中國行政體制改革研究會學術委員會副主任汪玉凱對《中國新聞周刊》指出，機構改革是要“一竿子插到底”，一些機構地方必須要設置。例如中央社會工作部的組建，在新一輪黨和國家機構改革中格外受到外界關注，根據《方案》，社會工作部門將在省、市、縣級黨委組建。汪玉凱表示，科技委、金融委等在新一輪機構改革中新設置的機構，基本也要按照這種模式設立下去。
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