日前馬英九在接見台商代表時的場合時重申，現在兩岸直航班次還不夠，希望能增加到一星期超過五百班，才能讓直航票價更低、兩岸往來更方便；今年八月底台灣“交通部”民航局長尹承蓬表示，規劃台灣增加飛北京、深圳各4個班次，他並且強調，協商兩岸直航增班，沒有誰對誰“讓利”的問題，兩岸是平等互惠。但大陸方面則認為又是展現讓利。
無論有無讓利，日前兩岸航班增班爭議已初步達成共識，雙方的認知差距大致消弭，都能相互體諒對方的難點。大陸方面承諾將盡力協調，避免“紅眼航班”情況，目前兩岸新增航班陸續開航，這對於兩岸企業及人民，自然都是令人振奮的好消息，對於航空業者來說，也化解內心一股不安的情緒，但情況總是還有加強的空間。
打從今年五月時，兩岸達成增班協議共識，預定直航班機從每周共270班增為370班，雙方各50班，除台北松山與上海虹橋雙方各14班，已在六月十四日對飛實施外，因兩岸對新增航班中，飛福建廈門或福州的認知不同，造成其它大部分新增班的申請受到影響。大陸方面要求新增二十個航班，台灣方面則認為增班之前，台灣的航空公司已經開航的海西航班，每週已有二十二班，大陸僅開航八班，可以想見台灣方面飛航航班早已超過大陸預期，也符合市場需求，故應可將其納入新增航班計算；但大陸方面卻認為，必須另外新增，兩岸認知差距一直無法弭平，使台灣的華航、長榮及復興航空公司等，原訂七月後的三十六班增班計劃因而全面暫緩，基於雙方對等原則，台灣民航局也就不核准對岸新增航班飛航，但在更進一步商談後，民航局亦表示，對於還未核准的新增航班將可全部重新申請，預期在八月底，新增航班就會陸續恢復；不過，台灣在其餘新增的36班航班額度中，要全部飛滿可能仍有難度。
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