對於國民黨內的各個派系，蔣介石也十分警惕，深怕它們在背後搞自己的“小動作”。桂系、湘系、粵系、西北系、東北系、川系、滇系、閻（錫山）系以及各地方實力派（如新疆的盛世才、青海甘肅的“三馬”等等），歷史上與他蔣介石有過多次分分合合，恩恩怨怨，甚至兵戎相見。因此蔣介石一貫重視搞異己派別的情報，並要六組及時提供。例如1943年4月28日，蔣介石親自召見六組組長唐縱，要唐“注意唐孟瀟（唐生智）、何雲樵（何鍵）在湖南的活動，但不可使其察覺”。
蔣介石為什麼把這樣機密的任務交給侍從室？因為侍從室是他心目中最可靠的機構，侍從室人員是他手下最可信任和囑托的人員。即使是見不得人的事，也可交其承辦。
有人還把侍從室稱為蔣介石的“智囊團”，這話很有道理。這方面的事例也不勝枚舉。
1940年1月，戴笠從杜月笙處獲得一份絕密情報，內容是汪精衛與日本訂立的賣國密約。蔣介石得到報告後，立即指定侍從室二處主任陳布雷和“日本通”張群一起關起門來研究，提供了對策。
再如1948年國民黨召開所謂“行憲國大”後，第一屆內閣即行政院長的人選，成了國內外矚目的焦點。誰來當這個院長？各派系都躍躍欲試，爭之者甚多。蔣介石當然不肯放棄這塊陣地，提出由他最信得過的政學系頭目張群充任。但是，國內輿論普遍反對黨派色彩太濃的人當行政院長，就連大洋彼岸一向標榜民主自由的美國也希望蔣“總統”的內閣能夠“民主化”一點，不要太“清一色”，以改善形象，欺負民眾。其時蔣介石在各個戰場上迭遭敗績，急需得到“美援”，尤其是美國軍火的支持。在這樣的背景下，蔣介石與陳布雷作了多次密談，最後終於采納陳的意見，放棄了？先“欽定”的張群，改由無黨派地質博士翁文灝出任行政院長。
侍從室裡的“智囊”遠不止陳布雷一人，其他如張治中、賀耀祖、林蔚、錢大鈞等人，也都工於謀略，是蔣介石的智囊人物。至於組長一級幹部中，也有侍二組組長於達、侍四組組長陳方（字芷町）、侍六組組長唐縱等人，常主動為蔣介石出謀劃策。
以唐縱為例，他在日記中曾多次記載自己為蔣介石出了哪些主意，提了哪些建議。1940年6月1日，唐縱向蔣介石呈交了《國際現勢之觀察及其對策》，洋洋3000餘言，建議聯蘇聯美以抗衡日本。蔣介石閱後表示滿意，“禦筆”批曰：“可嘉勉。”
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