從大陸方面來看，互設辦事機構亦有其需要性及功能性，隨著來台陸客陸生的增加，兩岸各項事務接觸的頻繁，因此對此議題大陸當局自當也是樂觀其成，但相當可惜現今卡在幾個關鍵點，使兩岸兩會辦事機構蒙上了一層陰影。
其次，關於此辦事機構究竟是政治性還是經濟性，其實既有經濟性亦有政治性，由此更可看出兩岸事務很難強調單一性，應是綜合性；不久前馬英九才提出兩岸互設機構這個議題“非經濟性質而是政治性質”，但辦事機構本身是中性的，只處理事務性、服務性的工作，不具政治意涵，也沒有決策權。這種詮釋與說法和過去的說法並無不一致之處，況且無論是政治性也好，經濟性也罷，重點在於能否達到服務台灣民眾與台商的目的，是否守住台灣方面基本的原則。
再者，不管互設辦事機構是什麼屬性，逢中必反的人永遠都不會支持與滿意，兩岸之間目前為一國兩區法律關係；“九二共識”雖是維繫兩岸和平發展的要件，卻不能徹底解決兩岸結構性的基本矛盾。大陸堅持“一中”原則，台灣強調“各表”的內涵；大陸擔心“和平分裂”，台灣不願“和平統一”；雙方互不承認主權，卻又無法否認對方治權存在的事實；雙方都有和平發展的意願，卻又都把雙方視作假想敵，這才是兩岸兩會互設辦事機構的本質性衝突之所在。
從兩岸機構交流來看，互設辦事機構自然是兩岸具體合作的方式之一，透過從兩岸到兩會實質進行協商，以解決民眾實際問題為依歸，包括經貿、文教、旅遊、交流、聯繫與文書證件等項目的服務，既處理經貿糾紛，又以服務及功能為導向，針對不同的個案情況，予以不同的處理。雖然互設辦事機構仍有一些挑戰及壓力，包括最難以解決的名稱及主權問題，兩岸間的彼此相互定位都是很難在短時間便得到解決，需要耐心與智慧不斷地進行相關協商。
|
