一是城鄉要素流動仍然存在障礙。城鄉二元的戶籍壁壘沒有根本消除，城鄉統一的建設用地市場尚未建立，城鄉金融資源配置嚴重失衡。這導致人才、土地、資金等要素更多地流向城市，農村發展缺乏要素支撐。
二是城鄉公共資源配置仍不合理。農村基礎設施和公共服務設施的歷史欠賬仍然較多、短板依舊突出。比如，城市的污水、生活垃圾處理率分別為95%、97%，而農村僅為22%、60%；城市的每千人衛生技術人員數為10.9人，而農村僅為4.3人。
三是現代農業產業體系尚不健全。農業的生產體系、經營體系和組織體系還不完善，農業的產業鏈短、附加值低、競爭力弱，農產品（5.220， －0.49， －8.58%）的階段性供過於求和供給不足並存，供給質量和效益都亟待提高，支農體系仍然相對薄弱。
四是農民增收長效機制有待完善。雖然城鄉居民收入比從最高點的2007年3.14倍，持續下降到2012年的2.88倍，進而下降到2018年的2.69倍，但近幾年的縮小幅度逐漸收窄，農民持續增收面臨比較大的挑戰。
第二方面：建立健全城鄉融合發展體制機制和政策體系的原則和目標
建立健全城鄉融合發展體制機制和政策體系是一項長期歷史任務，需要整體謀劃、明確方向。
總的方向是：以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，全面貫徹黨的十九大和十九屆二中、三中全會精神，以協調推進鄉村振興戰略和新型城鎮化戰略為抓手，以縮小城鄉發展差距和居民生活水平差距為目標，以完善產權制度和要素市場化配置為重點，促進城鄉要素自由流動、平等交換和公共資源合理配置，加快形成工農互促、城鄉互補、全面融合、共同繁榮的新型工農城鄉關係，加快推進農業農村現代化。
在改革的過程中，需要把握好5條大的原則：
一是堅持遵循規律、把握方向。我國還處在城鎮化較快發展階段的中後期，農民進城還是大趨勢，但也到了工業反哺農業、城市支持農村的階段。因此，要順應城鎮化大趨勢，樹立城鄉一盤棋理念，突出以工促農、以城帶鄉，構建促進城鄉規劃布局、要素配置、產業發展、基礎設施、公共服務、生態保護等相互融合和協同發展的體制機制。
二是堅持整體謀劃、重點突破。堅持目標導向和問題導向相結合，既要圍繞現代化國家建設目標進行整體設計，又要著力解決當前面臨的突出問題。因此，要圍繞鄉村全面振興和社會主義現代化國家建設目標，強化統籌謀劃和頂層設計，並著力破除戶籍、土地、資本、公共服務等方面的體制機制弊端。
三是堅持因地制宜、循序漸進。我國的國土地域廣闊，不同地區的發展基礎和水平差異很大，改革的涉及面廣、難度大。因此，要從各地區實際出發，充分考慮不同地區城鄉融合發展階段和鄉村差異性，穩妥把握改革時序、節奏和步驟，分類施策、梯次推進，試點先行、久久為功。
四是堅持守住底線、防範風險。要正確處理改革發展穩定的關係，在推進體制機制破舊立新過程中，守住土地所有制性質不改變、耕地紅線不突破、農民利益不受損的底線，守住生態保護的紅線，守住鄉村文化的根脈，高度重視和有效防範各類政治經濟社會風險。無論做哪些改革創新，都必須守住這幾條底線紅線。要防止鄉村產業發展起來了，但是環境被破壞了、鄉愁沒有了。
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