八、將第十四條中的“經海關關長批准”修改為“經直屬海關關長或者其授權的隸屬海關關長批准”。
九、將第十五條修改為：“海關進行稽查時，發現被稽查人有可能轉移、隱匿、篡改、毀棄賬簿、單證等有關資料的，經直屬海關關長或者其授權的隸屬海關關長批准，可以查封、扣押其賬簿、單證等有關資料以及相關電子數據存儲介質。採取該項措施時，不得妨礙被稽查人正常的生產經營活動。
“海關對有關情況查明或者取證後，應當立即解除對賬簿、單證等有關資料以及相關電子數據存儲介質的查封、扣押。”
十、將第十六條中的“經海關關長批准”修改為“經直屬海關關長或者其授權的隸屬海關關長批准”；將“封存”修改為“查封、扣押”。
十一、增加一條，作為第二十一條：“海關進行稽查時，可以委托會計、稅務等方面的專業機構就相關問題作出專業結論。
“被稽查人委托會計、稅務等方面的專業機構作出的專業結論，可以作為海關稽查的參考依據。”
十二、將第二十一條改為第二十二條，修改為：“海關稽查組實施稽查後，應當向海關報送稽查報告。稽查報告認定被稽查人涉嫌違法的，在報送海關前應當就稽查報告認定的事實徵求被稽查人的意見，被稽查人應當自收到相關材料之日起7日內，將其書面意見送交海關。”
十三、將第二十二條改為第二十三條，增加一款，作為第二款：“海關應當在稽查結論中說明作出結論的理由，並告知被稽查人的權利。”
十四、將第二十五條改為第二十六條，並將其中的“違反海關監管的行為”修改為“違反海關監管規定的行為”；增加一款，作為第二款：“與進出口貨物直接有關的企業、單位主動向海關報告其違反海關監管規定的行為，並接受海關處理的，應當從輕或者減輕行政處罰。”
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