事實上，南海不僅蘊藏有豐富的常規油氣資源，而且非常規油氣資源儲量也同樣令人矚目。尤其是被稱之為21世紀新能源的可燃冰，南海的可燃冰資源儲量十分龐大。
經過多年的地質調查，中國相繼在東沙海域、珠江口海域、瓊東南海域以及西沙海域發現了大面積的可燃冰富集帶。南沙海域也初步圈定了可燃冰資源的目標區域。
根據國土資源部的調查統計，整個南海的可燃冰地質儲量約為700億噸油當量，遠景資源儲量可達上千億噸油當量，資源開發前景十分廣闊。
早在2007年，國土資源部廣州海洋地調局在南海北部“神狐區塊”實施鑽探作業，一舉成功鑽獲可燃冰實物樣品。而到2008年，中國台灣地質調查部門也在台西南海域鑽探獲得了可燃冰樣品。
2011年1月，中國國土資源部發布報告稱，中國在南海北部圈定出11個可燃冰礦體，可燃冰礦區總面積22平方公里，總資源儲量約194億立方米天然氣，由此可見可燃冰的巨大潛力和開發價值。
有關專家認為，南海將成為中國未來油氣資源開發的重要接續區，有望建設成為中國海洋能源開發基地。
南海蘊藏有豐富的可燃冰資源，一方面再次表明了南海所蘊藏的資源價值，強化了南海的重要地位；另一方面，也會加大南海周邊各國對海洋資源的聲索及開發投入力度，加大南海問題的複雜化程度以及和平解決的難度。
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